Protein–RNA interactions for Protein: Q03338

PRP3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein PRP3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP3Q03338 COG8YML071C 1824 nt0.86□□□□□ -2.27
PRP3Q03338 YDR413CYDR413C 576 nt0.85□□□□□ -2.27
PRP3Q03338 ATP6Q0085 780 nt0.85□□□□□ -2.27
PRP3Q03338 ISD11YER048W-A 285 nt0.85□□□□□ -2.27
PRP3Q03338 PAM16YJL104W 450 nt0.85□□□□□ -2.27
PRP3Q03338 YNL211CYNL211C 261 nt0.85□□□□□ -2.27
PRP3Q03338 HTL1YCR020W-B 237 nt0.84□□□□□ -2.27
PRP3Q03338 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt0.84□□□□□ -2.27
PRP3Q03338 YGL149WYGL149W 306 nt0.84□□□□□ -2.27
PRP3Q03338 PAU12YGR294W 363 nt0.84□□□□□ -2.27
PRP3Q03338 YKL118WYKL118W 312 nt0.84□□□□□ -2.27
PRP3Q03338 YPL044CYPL044C 549 nt0.84□□□□□ -2.27
PRP3Q03338 PAU24YBR301W 363 nt0.84□□□□□ -2.27
PRP3Q03338 VIK1YPL253C 1944 nt0.83□□□□□ -2.28
PRP3Q03338 NOP9YJL010C 2001 nt0.83□□□□□ -2.28
PRP3Q03338 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.83□□□□□ -2.28
PRP3Q03338 YFL063WYFL063W 456 nt0.82□□□□□ -2.28
PRP3Q03338 RPS27BYHR021C 249 nt0.82□□□□□ -2.28
PRP3Q03338 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt0.82□□□□□ -2.28
PRP3Q03338 YMR321CYMR321C 318 nt0.82□□□□□ -2.28
PRP3Q03338 YOR282WYOR282W 321 nt0.82□□□□□ -2.28
PRP3Q03338 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt0.81□□□□□ -2.28
PRP3Q03338 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.81□□□□□ -2.28
PRP3Q03338 YER097WYER097W 330 nt0.8□□□□□ -2.28
PRP3Q03338 YKL136WYKL136W 399 nt0.8□□□□□ -2.28
PRP3Q03338 YOR218CYOR218C 420 nt0.8□□□□□ -2.28
PRP3Q03338 PAA1YDR071C 576 nt0.78□□□□□ -2.28
PRP3Q03338 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.78□□□□□ -2.28
PRP3Q03338 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.78□□□□□ -2.28
PRP3Q03338 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.78□□□□□ -2.28
PRP3Q03338 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.78□□□□□ -2.28
PRP3Q03338 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.78□□□□□ -2.28
PRP3Q03338 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.78□□□□□ -2.28
PRP3Q03338 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.78□□□□□ -2.28
PRP3Q03338 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.78□□□□□ -2.28
PRP3Q03338 CSE2YNR010W 450 nt0.78□□□□□ -2.28
PRP3Q03338 SEC1YDR164C 2175 nt0.77□□□□□ -2.29
PRP3Q03338 PMP1YCR024C-A 123 nt0.77□□□□□ -2.29
PRP3Q03338 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.77□□□□□ -2.29
PRP3Q03338 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.77□□□□□ -2.29
PRP3Q03338 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.77□□□□□ -2.29
PRP3Q03338 ASE1YOR058C 2658 nt0.76□□□□□ -2.29
PRP3Q03338 STE5YDR103W 2754 nt0.75□□□□□ -2.29
PRP3Q03338 UBP3YER151C 2739 nt0.75□□□□□ -2.29
PRP3Q03338 QCR9YGR183C 201 nt0.75□□□□□ -2.29
PRP3Q03338 NPR2YEL062W 1848 nt0.75□□□□□ -2.29
PRP3Q03338 RPL26BYGR034W 384 nt0.74□□□□□ -2.29
PRP3Q03338 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.74□□□□□ -2.29
PRP3Q03338 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.73□□□□□ -2.29
PRP3Q03338 RPL39YJL189W 156 nt0.72□□□□□ -2.29
PRP3Q03338 YNL028WYNL028W 318 nt0.72□□□□□ -2.29
PRP3Q03338 CHS6YJL099W 2241 nt0.72□□□□□ -2.29
PRP3Q03338 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.71□□□□□ -2.3
PRP3Q03338 YSP1YHR155W 3687 nt0.7□□□□□ -2.3
PRP3Q03338 YOR015WYOR015W 360 nt0.7□□□□□ -2.3
PRP3Q03338 RAD61YDR014W 1944 nt0.7□□□□□ -2.3
PRP3Q03338 YML002WYML002W 2214 nt0.69□□□□□ -2.3
PRP3Q03338 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.69□□□□□ -2.3
PRP3Q03338 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.69□□□□□ -2.3
PRP3Q03338 UTP20YBL004W 7482 nt0.68□□□□□ -2.3
PRP3Q03338 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.68□□□□□ -2.3
PRP3Q03338 snR190snR190 190 nt0.67□□□□□ -2.3
PRP3Q03338 YGR069WYGR069W 336 nt0.66□□□□□ -2.3
PRP3Q03338 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.66□□□□□ -2.3
PRP3Q03338 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.66□□□□□ -2.3
PRP3Q03338 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt0.65□□□□□ -2.31
PRP3Q03338 UTP10YJL109C 5310 nt0.65□□□□□ -2.31
PRP3Q03338 LTE1YAL024C 4308 nt0.64□□□□□ -2.31
PRP3Q03338 MYO1YHR023W 5787 nt0.64□□□□□ -2.31
PRP3Q03338 COY1YKL179C 2040 nt0.64□□□□□ -2.31
PRP3Q03338 YOL014WYOL014W 375 nt0.64□□□□□ -2.31
PRP3Q03338 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.64□□□□□ -2.31
PRP3Q03338 YMR160WYMR160W 2451 nt0.64□□□□□ -2.31
PRP3Q03338 SEC8YPR055W 3198 nt0.63□□□□□ -2.31
PRP3Q03338 FYV10YIL097W 1551 nt0.63□□□□□ -2.31
PRP3Q03338 COX5BYIL111W 456 nt0.63□□□□□ -2.31
PRP3Q03338 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.63□□□□□ -2.31
PRP3Q03338 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt0.63□□□□□ -2.31
PRP3Q03338 YPR092WYPR092W 306 nt0.63□□□□□ -2.31
PRP3Q03338 snR74snR74 88 nt0.61□□□□□ -2.31
PRP3Q03338 YGL052WYGL052W 306 nt0.61□□□□□ -2.31
PRP3Q03338 YLR282CYLR282C 342 nt0.61□□□□□ -2.31
PRP3Q03338 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.61□□□□□ -2.31
PRP3Q03338 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.61□□□□□ -2.31
PRP3Q03338 Q0142Q0142 177 nt0.6□□□□□ -2.31
PRP3Q03338 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.6□□□□□ -2.31
PRP3Q03338 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt0.6□□□□□ -2.31
PRP3Q03338 PRP5YBR237W 2550 nt0.59□□□□□ -2.31
PRP3Q03338 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.59□□□□□ -2.31
PRP3Q03338 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.59□□□□□ -2.31
PRP3Q03338 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.59□□□□□ -2.31
PRP3Q03338 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt0.59□□□□□ -2.31
PRP3Q03338 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.58□□□□□ -2.32
PRP3Q03338 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.58□□□□□ -2.32
PRP3Q03338 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.58□□□□□ -2.32
PRP3Q03338 ULI1YFR026C 510 nt0.57□□□□□ -2.32
PRP3Q03338 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.57□□□□□ -2.32
PRP3Q03338 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt0.57□□□□□ -2.32
PRP3Q03338 OST4YDL232W 111 nt0.56□□□□□ -2.32
PRP3Q03338 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.55□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 44 ms