Protein–RNA interactions for Protein: P40105

YRF1-2, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-2P40105 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt-0.73□□□□□ -2.53
YRF1-2P40105 BER1YLR412W 825 nt-0.74□□□□□ -2.53
YRF1-2P40105 APQ13YJL075C 417 nt-0.75□□□□□ -2.53
YRF1-2P40105 YPT6YLR262C 648 nt-0.75□□□□□ -2.53
YRF1-2P40105 YOL029CYOL029C 606 nt-0.75□□□□□ -2.53
YRF1-2P40105 YLR287CYLR287C 1068 nt-0.75□□□□□ -2.53
YRF1-2P40105 MRPS8YMR158W 468 nt-0.75□□□□□ -2.53
YRF1-2P40105 YPL182CYPL182C 384 nt-0.76□□□□□ -2.53
YRF1-2P40105 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.77□□□□□ -2.53
YRF1-2P40105 GRX5YPL059W 453 nt-0.77□□□□□ -2.53
YRF1-2P40105 POP7YBR167C 423 nt-0.77□□□□□ -2.53
YRF1-2P40105 YHR138CYHR138C 345 nt-0.78□□□□□ -2.53
YRF1-2P40105 TAR1YLR154W-C 375 nt-0.78□□□□□ -2.53
YRF1-2P40105 YER135CYER135C 393 nt-0.78□□□□□ -2.53
YRF1-2P40105 YBR099CYBR099C 384 nt-0.78□□□□□ -2.53
YRF1-2P40105 PCF11YDR228C 1881 nt-0.79□□□□□ -2.54
YRF1-2P40105 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt-0.8□□□□□ -2.54
YRF1-2P40105 SDH7YDR511W 402 nt-0.81□□□□□ -2.54
YRF1-2P40105 RPF1YHR088W 888 nt-0.81□□□□□ -2.54
YRF1-2P40105 HMLALPHA2YCL067C 633 nt-0.81□□□□□ -2.54
YRF1-2P40105 MATALPHA2YCR039C 633 nt-0.81□□□□□ -2.54
YRF1-2P40105 HMRA2YCR096C 360 nt-0.81□□□□□ -2.54
YRF1-2P40105 YER175W-AYER175W-A 165 nt-0.81□□□□□ -2.54
YRF1-2P40105 snR161snR161 161 nt-0.81□□□□□ -2.54
YRF1-2P40105 TSC3YBR058C-A 243 nt-0.81□□□□□ -2.54
YRF1-2P40105 YDL011CYDL011C 324 nt-0.83□□□□□ -2.54
YRF1-2P40105 YGL230CYGL230C 444 nt-0.83□□□□□ -2.54
YRF1-2P40105 YHL041WYHL041W 450 nt-0.83□□□□□ -2.54
YRF1-2P40105 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.83□□□□□ -2.54
YRF1-2P40105 YNL058CYNL058C 951 nt-0.83□□□□□ -2.54
YRF1-2P40105 YCR001WYCR001W 315 nt-0.84□□□□□ -2.54
YRF1-2P40105 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.84□□□□□ -2.54
YRF1-2P40105 SGF11YPL047W 300 nt-0.84□□□□□ -2.54
YRF1-2P40105 YGR025WYGR025W 303 nt-0.84□□□□□ -2.54
YRF1-2P40105 snR9snR9 187 nt-0.85□□□□□ -2.55
YRF1-2P40105 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt-0.85□□□□□ -2.55
YRF1-2P40105 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt-0.85□□□□□ -2.55
YRF1-2P40105 YLR334CYLR334C 381 nt-0.86□□□□□ -2.55
YRF1-2P40105 YCR100CYCR100C 951 nt-0.87□□□□□ -2.55
YRF1-2P40105 YLR282CYLR282C 342 nt-0.88□□□□□ -2.55
YRF1-2P40105 RPS25BYLR333C 327 nt-0.88□□□□□ -2.55
YRF1-2P40105 COG6YNL041C 2520 nt-0.88□□□□□ -2.55
YRF1-2P40105 EST1YLR233C 2100 nt-0.89□□□□□ -2.55
YRF1-2P40105 YBL062WYBL062W 381 nt-0.89□□□□□ -2.55
YRF1-2P40105 YPR092WYPR092W 306 nt-0.89□□□□□ -2.55
YRF1-2P40105 SNU13YEL026W 381 nt-0.91□□□□□ -2.55
YRF1-2P40105 FYV7YLR068W 456 nt-0.91□□□□□ -2.55
YRF1-2P40105 AGA2YGL032C 264 nt-0.91□□□□□ -2.56
YRF1-2P40105 YLR041WYLR041W 321 nt-0.93□□□□□ -2.56
YRF1-2P40105 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt-0.93□□□□□ -2.56
YRF1-2P40105 BLI1YKL061W 342 nt-0.94□□□□□ -2.56
YRF1-2P40105 SCEIQ0160 708 nt-0.94□□□□□ -2.56
YRF1-2P40105 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt-0.94□□□□□ -2.56
YRF1-2P40105 YDR366CYDR366C 399 nt-0.95□□□□□ -2.56
YRF1-2P40105 YKL044WYKL044W 321 nt-0.95□□□□□ -2.56
YRF1-2P40105 ZEO1YOL109W 342 nt-0.95□□□□□ -2.56
YRF1-2P40105 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt-0.95□□□□□ -2.56
YRF1-2P40105 YMR254CYMR254C 309 nt-0.96□□□□□ -2.56
YRF1-2P40105 MND1YGL183C 660 nt-0.97□□□□□ -2.56
YRF1-2P40105 YBL071CYBL071C 309 nt-0.97□□□□□ -2.56
YRF1-2P40105 YNL303WYNL303W 348 nt-0.97□□□□□ -2.56
YRF1-2P40105 YDR426CYDR426C 378 nt-0.97□□□□□ -2.57
YRF1-2P40105 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.97□□□□□ -2.57
YRF1-2P40105 YML007C-AYML007C-A 111 nt-0.98□□□□□ -2.57
YRF1-2P40105 YPL068CYPL068C 882 nt-0.98□□□□□ -2.57
YRF1-2P40105 CMC1YKL137W 336 nt-0.99□□□□□ -2.57
YRF1-2P40105 AIM29YKR074W 468 nt-0.99□□□□□ -2.57
YRF1-2P40105 snR36snR36 182 nt-0.99□□□□□ -2.57
YRF1-2P40105 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-1□□□□□ -2.57
YRF1-2P40105 YER079WYER079W 633 nt-1□□□□□ -2.57
YRF1-2P40105 YPL229WYPL229W 621 nt-1□□□□□ -2.57
YRF1-2P40105 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt-1□□□□□ -2.57
YRF1-2P40105 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt-1.01□□□□□ -2.57
YRF1-2P40105 PAU9YBL108C-A 129 nt-1.01□□□□□ -2.57
YRF1-2P40105 YAR029WYAR029W 225 nt-1.02□□□□□ -2.57
YRF1-2P40105 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt-1.04□□□□□ -2.58
YRF1-2P40105 YKL083WYKL083W 615 nt-1.05□□□□□ -2.58
YRF1-2P40105 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt-1.05□□□□□ -2.58
YRF1-2P40105 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt-1.06□□□□□ -2.58
YRF1-2P40105 YIL029CYIL029C 429 nt-1.07□□□□□ -2.58
YRF1-2P40105 YOR015WYOR015W 360 nt-1.07□□□□□ -2.58
YRF1-2P40105 SDH6YDR379C-A 240 nt-1.08□□□□□ -2.58
YRF1-2P40105 YJR087WYJR087W 351 nt-1.08□□□□□ -2.58
YRF1-2P40105 YHR130CYHR130C 336 nt-1.1□□□□□ -2.58
YRF1-2P40105 YDL016CYDL016C 303 nt-1.12□□□□□ -2.59
YRF1-2P40105 YLR456WYLR456W 615 nt-1.13□□□□□ -2.59
YRF1-2P40105 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt-1.13□□□□□ -2.59
YRF1-2P40105 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt-1.13□□□□□ -2.59
YRF1-2P40105 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt-1.13□□□□□ -2.59
YRF1-2P40105 YER084W-AYER084W-A 513 nt-1.15□□□□□ -2.59
YRF1-2P40105 YFL012WYFL012W 447 nt-1.15□□□□□ -2.59
YRF1-2P40105 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt-1.16□□□□□ -2.59
YRF1-2P40105 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-1.18□□□□□ -2.6
YRF1-2P40105 YGL182CYGL182C 324 nt-1.19□□□□□ -2.6
YRF1-2P40105 YFL063WYFL063W 456 nt-1.2□□□□□ -2.6
YRF1-2P40105 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt-1.2□□□□□ -2.6
YRF1-2P40105 YJL182CYJL182C 318 nt-1.21□□□□□ -2.6
YRF1-2P40105 YER053C-AYER053C-A 114 nt-1.22□□□□□ -2.6
YRF1-2P40105 PCC1YKR095W-A 267 nt-1.23□□□□□ -2.61
YRF1-2P40105 YIL032CYIL032C 357 nt-1.23□□□□□ -2.61
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 49.8 ms