Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Speer4aF8VPX6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Speer4aF8VPX6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Speer4aF8VPX6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Speer4aF8VPX6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Speer4aF8VPX6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Speer4aF8VPX6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Speer4aF8VPX6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Speer4aF8VPX6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Speer4aF8VPX6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Speer4aF8VPX6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Speer4aF8VPX6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Speer4aF8VPX6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Speer4aF8VPX6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Speer4aF8VPX6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Speer4aF8VPX6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Speer4aF8VPX6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Speer4aF8VPX6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Speer4aF8VPX6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Speer4aF8VPX6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Speer4aF8VPX6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms