Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms