Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NipblQ6KCD5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms