Protein–RNA interactions for Protein: Q12267

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, yeast

Predictions only

Length 1,418 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SMC4	Q12267	YHR131W-A	YHR131W-A	246 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
SMC4	Q12267	PSF2	YJL072C	642 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
SMC4	Q12267	SDS22	YKL193C	1017 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
SMC4	Q12267	YCR024C-B	YCR024C-B	267 nt		-1	□□□□□ -2.57
SMC4	Q12267	YAP6	YDR259C	1152 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
SMC4	Q12267	SEM1	YDR363W-A	270 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
SMC4	Q12267	YER138W-A	YER138W-A	105 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
SMC4	Q12267	THG1	YGR024C	714 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
SMC4	Q12267	tN(GUU)Q	tN(GUU)Q	71 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
SMC4	Q12267	YJL135W	YJL135W	318 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
SMC4	Q12267	YMR290W-A	YMR290W-A	348 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
SMC4	Q12267	SUS1	YBR111W-A	291 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
SMC4	Q12267	RSM23	YGL129C	1353 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
SMC4	Q12267	IPP1	YBR011C	864 nt		-1.02	□□□□□ -2.57
SMC4	Q12267	snR161	snR161	161 nt		-1.02	□□□□□ -2.57
SMC4	Q12267	YNL067W-B	YNL067W-B	141 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
SMC4	Q12267	YNL319W	YNL319W	441 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
SMC4	Q12267	YOR248W	YOR248W	303 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
SMC4	Q12267	YJL120W	YJL120W	324 nt		-1.04	□□□□□ -2.58
SMC4	Q12267	YBL008W-A	YBL008W-A	240 nt		-1.04	□□□□□ -2.58
SMC4	Q12267	COX7	YMR256C	183 nt		-1.04	□□□□□ -2.58
SMC4	Q12267	UBS1	YBR165W	834 nt		-1.04	□□□□□ -2.58
SMC4	Q12267	YGR115C	YGR115C	780 nt		-1.05	□□□□□ -2.58
SMC4	Q12267	YLL006W-A	YLL006W-A	177 nt		-1.05	□□□□□ -2.58
SMC4	Q12267	ECL1	YGR146C	636 nt		-1.06	□□□□□ -2.58
SMC4	Q12267	RUF20	RUF20	443 nt		-1.06	□□□□□ -2.58
SMC4	Q12267	SPO21	YOL091W	1830 nt		-1.06	□□□□□ -2.58
SMC4	Q12267	YHL046W-A	YHL046W-A	327 nt		-1.06	□□□□□ -2.58
SMC4	Q12267	YJR140W-A	YJR140W-A	150 nt		-1.07	□□□□□ -2.58
SMC4	Q12267	IRC2	YDR112W	309 nt		-1.08	□□□□□ -2.58
SMC4	Q12267	tT(UGU)Q1	tT(UGU)Q1	76 nt		-1.08	□□□□□ -2.58
SMC4	Q12267	DFG10	YIL049W	762 nt		-1.08	□□□□□ -2.58
SMC4	Q12267	MRPS8	YMR158W	468 nt		-1.08	□□□□□ -2.58
SMC4	Q12267	RPS10B	YMR230W	318 nt		-1.08	□□□□□ -2.58
SMC4	Q12267	AI5_BETA	Q0075	1065 nt		-1.09	□□□□□ -2.58
SMC4	Q12267	YKL068W-A	YKL068W-A	237 nt		-1.1	□□□□□ -2.59
SMC4	Q12267	YLR287C	YLR287C	1068 nt		-1.1	□□□□□ -2.59
SMC4	Q12267	VPS63	YLR261C	327 nt		-1.11	□□□□□ -2.59
SMC4	Q12267	BLS1	YLR408C	369 nt		-1.11	□□□□□ -2.59
SMC4	Q12267	YIL071W-A	YIL071W-A	477 nt		-1.12	□□□□□ -2.59
SMC4	Q12267	PBI2	YNL015W	228 nt		-1.13	□□□□□ -2.59
SMC4	Q12267	YOL160W	YOL160W	342 nt		-1.13	□□□□□ -2.59
SMC4	Q12267	YDR269C	YDR269C	324 nt		-1.14	□□□□□ -2.59
SMC4	Q12267	YLR171W	YLR171W	390 nt		-1.14	□□□□□ -2.59
SMC4	Q12267	YDL007C-A	YDL007C-A	258 nt		-1.15	□□□□□ -2.59
SMC4	Q12267	YML108W	YML108W	318 nt		-1.15	□□□□□ -2.59
SMC4	Q12267	YNL171C	YNL171C	369 nt		-1.15	□□□□□ -2.59
SMC4	Q12267	YHR054C	YHR054C	1065 nt		-1.16	□□□□□ -2.6
SMC4	Q12267	GRX5	YPL059W	453 nt		-1.17	□□□□□ -2.6
SMC4	Q12267	RPS25B	YLR333C	327 nt		-1.18	□□□□□ -2.6
SMC4	Q12267	GPX1	YKL026C	504 nt		-1.19	□□□□□ -2.6
SMC4	Q12267	YML007C-A	YML007C-A	111 nt		-1.19	□□□□□ -2.6
SMC4	Q12267	YOR020W-A	YOR020W-A	273 nt		-1.19	□□□□□ -2.6
SMC4	Q12267	snR59	snR59	78 nt		-1.2	□□□□□ -2.6
SMC4	Q12267	tA(UGC)Q	tA(UGC)Q	76 nt		-1.2	□□□□□ -2.6
SMC4	Q12267	YOL106W	YOL106W	354 nt		-1.2	□□□□□ -2.6
SMC4	Q12267	DCP1	YOL149W	696 nt		-1.2	□□□□□ -2.6
SMC4	Q12267	ATG31	YDR022C	591 nt		-1.21	□□□□□ -2.6
SMC4	Q12267	PCF11	YDR228C	1881 nt		-1.21	□□□□□ -2.6
SMC4	Q12267	YIR044C	YIR044C	186 nt		-1.22	□□□□□ -2.6
SMC4	Q12267	YKL111C	YKL111C	336 nt		-1.22	□□□□□ -2.6
SMC4	Q12267	YDL185C-A	YDL185C-A	228 nt		-1.23	□□□□□ -2.61
SMC4	Q12267	POP6	YGR030C	477 nt		-1.23	□□□□□ -2.61
SMC4	Q12267	YBR099C	YBR099C	384 nt		-1.23	□□□□□ -2.61
SMC4	Q12267	EST1	YLR233C	2100 nt		-1.23	□□□□□ -2.61
SMC4	Q12267	YHR138C	YHR138C	345 nt		-1.23	□□□□□ -2.61
SMC4	Q12267	YMR307C-A	YMR307C-A	195 nt		-1.24	□□□□□ -2.61
SMC4	Q12267	YPL261C	YPL261C	309 nt		-1.24	□□□□□ -2.61
SMC4	Q12267	LRP1	YHR081W	555 nt		-1.25	□□□□□ -2.61
SMC4	Q12267	LIN1	YHR156C	1023 nt		-1.25	□□□□□ -2.61
SMC4	Q12267	CWC23	YGL128C	852 nt		-1.26	□□□□□ -2.61
SMC4	Q12267	IRC16	YPR038W	360 nt		-1.27	□□□□□ -2.61
SMC4	Q12267	SDH7	YDR511W	402 nt		-1.28	□□□□□ -2.61
SMC4	Q12267	YGL258W-A	YGL258W-A	234 nt		-1.28	□□□□□ -2.61
SMC4	Q12267	POL32	YJR043C	1053 nt		-1.28	□□□□□ -2.61
SMC4	Q12267	YOL029C	YOL029C	606 nt		-1.28	□□□□□ -2.61
SMC4	Q12267	snR57	snR57	88 nt		-1.3	□□□□□ -2.62
SMC4	Q12267	snR72	snR72	98 nt		-1.3	□□□□□ -2.62
SMC4	Q12267	YER079W	YER079W	633 nt		-1.3	□□□□□ -2.62
SMC4	Q12267	YLR041W	YLR041W	321 nt		-1.3	□□□□□ -2.62
SMC4	Q12267	YMR158W-B	YMR158W-B	321 nt		-1.3	□□□□□ -2.62
SMC4	Q12267	YNL067W-A	YNL067W-A	147 nt		-1.3	□□□□□ -2.62
SMC4	Q12267	YCR018C-A	YCR018C-A	255 nt		-1.31	□□□□□ -2.62
SMC4	Q12267	YER188C-A	YER188C-A	300 nt		-1.31	□□□□□ -2.62
SMC4	Q12267	YGR228W	YGR228W	345 nt		-1.31	□□□□□ -2.62
SMC4	Q12267	YMR304C-A	YMR304C-A	351 nt		-1.32	□□□□□ -2.62
SMC4	Q12267	YOR364W	YOR364W	369 nt		-1.32	□□□□□ -2.62
SMC4	Q12267	ACF4	YJR083C	930 nt		-1.33	□□□□□ -2.62
SMC4	Q12267	YOR366W	YOR366W	354 nt		-1.33	□□□□□ -2.62
SMC4	Q12267	YOR015W	YOR015W	360 nt		-1.34	□□□□□ -2.62
SMC4	Q12267	YPR092W	YPR092W	306 nt		-1.34	□□□□□ -2.62
SMC4	Q12267	BER1	YLR412W	825 nt		-1.36	□□□□□ -2.63
SMC4	Q12267	IRC13	YOR235W	315 nt		-1.37	□□□□□ -2.63
SMC4	Q12267	RPS20	YHL015W	366 nt		-1.38	□□□□□ -2.63
SMC4	Q12267	RPF1	YHR088W	888 nt		-1.38	□□□□□ -2.63
SMC4	Q12267	TAR1	YLR154W-C	375 nt		-1.38	□□□□□ -2.63
SMC4	Q12267	RRI2	YOL117W	1938 nt		-1.38	□□□□□ -2.63
SMC4	Q12267	SNU13	YEL026W	381 nt		-1.39	□□□□□ -2.63
SMC4	Q12267	BLI1	YKL061W	342 nt		-1.39	□□□□□ -2.63
SMC4	Q12267	LOC1	YFR001W	615 nt		-1.4	□□□□□ -2.63

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