Protein–RNA interactions for Protein: Q12235

YCT1, High affinity cysteine transporter, yeastyeast

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YCT1Q12235 ECM12YHR021W-A 456 nt0.55□□□□□ -2.32
YCT1Q12235 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.55□□□□□ -2.32
YCT1Q12235 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.55□□□□□ -2.32
YCT1Q12235 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.55□□□□□ -2.32
YCT1Q12235 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.55□□□□□ -2.32
YCT1Q12235 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.55□□□□□ -2.32
YCT1Q12235 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.55□□□□□ -2.32
YCT1Q12235 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.55□□□□□ -2.32
YCT1Q12235 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.55□□□□□ -2.32
YCT1Q12235 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.55□□□□□ -2.32
YCT1Q12235 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.55□□□□□ -2.32
YCT1Q12235 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.55□□□□□ -2.32
YCT1Q12235 CUL3YGR003W 2235 nt0.54□□□□□ -2.32
YCT1Q12235 PCF11YDR228C 1881 nt0.54□□□□□ -2.32
YCT1Q12235 PMP1YCR024C-A 123 nt0.54□□□□□ -2.32
YCT1Q12235 YAR047CYAR047C 321 nt0.54□□□□□ -2.32
YCT1Q12235 INP2YMR163C 2118 nt0.54□□□□□ -2.32
YCT1Q12235 ATP19YOL077W-A 207 nt0.54□□□□□ -2.32
YCT1Q12235 UTP10YJL109C 5310 nt0.54□□□□□ -2.32
YCT1Q12235 YDR344CYDR344C 444 nt0.53□□□□□ -2.32
YCT1Q12235 ISF1YMR081C 1017 nt0.53□□□□□ -2.32
YCT1Q12235 NOP9YJL010C 2001 nt0.52□□□□□ -2.33
YCT1Q12235 RPL38YLR325C 237 nt0.52□□□□□ -2.33
YCT1Q12235 YNL058CYNL058C 951 nt0.52□□□□□ -2.33
YCT1Q12235 LTE1YAL024C 4308 nt0.51□□□□□ -2.33
YCT1Q12235 MRPL50YNR022C 420 nt0.51□□□□□ -2.33
YCT1Q12235 YBR064WYBR064W 429 nt0.51□□□□□ -2.33
YCT1Q12235 MAM33YIL070C 801 nt0.5□□□□□ -2.33
YCT1Q12235 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.5□□□□□ -2.33
YCT1Q12235 YJR011CYJR011C 786 nt0.5□□□□□ -2.33
YCT1Q12235 YML002WYML002W 2214 nt0.5□□□□□ -2.33
YCT1Q12235 CHS6YJL099W 2241 nt0.49□□□□□ -2.33
YCT1Q12235 YLL007CYLL007C 1998 nt0.49□□□□□ -2.33
YCT1Q12235 ATG31YDR022C 591 nt0.49□□□□□ -2.33
YCT1Q12235 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.49□□□□□ -2.33
YCT1Q12235 RPS20YHL015W 366 nt0.49□□□□□ -2.33
YCT1Q12235 YPL044CYPL044C 549 nt0.49□□□□□ -2.33
YCT1Q12235 NPR2YEL062W 1848 nt0.49□□□□□ -2.33
YCT1Q12235 YCK3YER123W 1575 nt0.49□□□□□ -2.33
YCT1Q12235 MCM10YIL150C 1716 nt0.48□□□□□ -2.33
YCT1Q12235 YBR206WYBR206W 324 nt0.48□□□□□ -2.33
YCT1Q12235 NIP100YPL174C 2607 nt0.47□□□□□ -2.33
YCT1Q12235 STF2YGR008C 255 nt0.47□□□□□ -2.33
YCT1Q12235 RPS24BYIL069C 408 nt0.47□□□□□ -2.33
YCT1Q12235 OLI1Q0130 231 nt0.46□□□□□ -2.34
YCT1Q12235 PTP2YOR208W 2253 nt0.46□□□□□ -2.34
YCT1Q12235 BSC3YLR465C 309 nt0.44□□□□□ -2.34
YCT1Q12235 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.44□□□□□ -2.34
YCT1Q12235 YOR218CYOR218C 420 nt0.44□□□□□ -2.34
YCT1Q12235 YPL185WYPL185W 396 nt0.44□□□□□ -2.34
YCT1Q12235 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.44□□□□□ -2.34
YCT1Q12235 YDR426CYDR426C 378 nt0.42□□□□□ -2.34
YCT1Q12235 YLR456WYLR456W 615 nt0.42□□□□□ -2.34
YCT1Q12235 HUG1YML058W-A 207 nt0.42□□□□□ -2.34
YCT1Q12235 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.41□□□□□ -2.34
YCT1Q12235 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.41□□□□□ -2.34
YCT1Q12235 YLR434CYLR434C 384 nt0.41□□□□□ -2.34
YCT1Q12235 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.41□□□□□ -2.34
YCT1Q12235 ASE1YOR058C 2658 nt0.4□□□□□ -2.35
YCT1Q12235 OST1YJL002C 1431 nt0.39□□□□□ -2.35
YCT1Q12235 RPL26BYGR034W 384 nt0.39□□□□□ -2.35
YCT1Q12235 PAA1YDR071C 576 nt0.38□□□□□ -2.35
YCT1Q12235 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.38□□□□□ -2.35
YCT1Q12235 SPO21YOL091W 1830 nt0.38□□□□□ -2.35
YCT1Q12235 YMR160WYMR160W 2451 nt0.38□□□□□ -2.35
YCT1Q12235 RPS30BYOR182C 192 nt0.37□□□□□ -2.35
YCT1Q12235 FYV10YIL097W 1551 nt0.36□□□□□ -2.35
YCT1Q12235 INA22YIR024C 651 nt0.36□□□□□ -2.35
YCT1Q12235 YNL211CYNL211C 261 nt0.36□□□□□ -2.35
YCT1Q12235 YSP1YHR155W 3687 nt0.35□□□□□ -2.35
YCT1Q12235 YJL007CYJL007C 315 nt0.35□□□□□ -2.35
YCT1Q12235 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.35□□□□□ -2.35
YCT1Q12235 PCC1YKR095W-A 267 nt0.35□□□□□ -2.35
YCT1Q12235 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.35□□□□□ -2.35
YCT1Q12235 YPL068CYPL068C 882 nt0.35□□□□□ -2.35
YCT1Q12235 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.34□□□□□ -2.36
YCT1Q12235 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.34□□□□□ -2.36
YCT1Q12235 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.34□□□□□ -2.36
YCT1Q12235 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.34□□□□□ -2.36
YCT1Q12235 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.34□□□□□ -2.36
YCT1Q12235 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.34□□□□□ -2.36
YCT1Q12235 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.34□□□□□ -2.36
YCT1Q12235 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.34□□□□□ -2.36
YCT1Q12235 SBH1YER087C-B 249 nt0.33□□□□□ -2.36
YCT1Q12235 YLR334CYLR334C 381 nt0.33□□□□□ -2.36
YCT1Q12235 YOR053WYOR053W 342 nt0.33□□□□□ -2.36
YCT1Q12235 MYO1YHR023W 5787 nt0.33□□□□□ -2.36
YCT1Q12235 FMP27YLR454W 7887 nt0.33□□□□□ -2.36
YCT1Q12235 UTP20YBL004W 7482 nt0.32□□□□□ -2.36
YCT1Q12235 PET111YMR257C 2403 nt0.32□□□□□ -2.36
YCT1Q12235 CSN9YDR179C 489 nt0.32□□□□□ -2.36
YCT1Q12235 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.32□□□□□ -2.36
YCT1Q12235 SGF11YPL047W 300 nt0.32□□□□□ -2.36
YCT1Q12235 YPL205CYPL205C 345 nt0.32□□□□□ -2.36
YCT1Q12235 ABF2YMR072W 552 nt0.31□□□□□ -2.36
YCT1Q12235 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.3□□□□□ -2.36
YCT1Q12235 HMRA2YCR096C 360 nt0.3□□□□□ -2.36
YCT1Q12235 TAR1YLR154W-C 375 nt0.3□□□□□ -2.36
YCT1Q12235 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.3□□□□□ -2.36
YCT1Q12235 SEC8YPR055W 3198 nt0.29□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.1 ms