Protein–RNA interactions for Protein: Q12048

ATG41, Autophagy-related protein 41, yeastyeast

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG41Q12048 NFU1YKL040C 771 nt0.17□□□□□ -2.38
ATG41Q12048 HUG1YML058W-A 207 nt0.17□□□□□ -2.38
ATG41Q12048 snR51snR51 107 nt0.17□□□□□ -2.38
ATG41Q12048 PET111YMR257C 2403 nt0.17□□□□□ -2.38
ATG41Q12048 INP2YMR163C 2118 nt0.16□□□□□ -2.38
ATG41Q12048 AI1Q0050 2505 nt0.16□□□□□ -2.38
ATG41Q12048 OLI1Q0130 231 nt0.16□□□□□ -2.38
ATG41Q12048 PAU12YGR294W 363 nt0.16□□□□□ -2.38
ATG41Q12048 YPL185WYPL185W 396 nt0.15□□□□□ -2.39
ATG41Q12048 BEM3YPL115C 3387 nt0.15□□□□□ -2.39
ATG41Q12048 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.14□□□□□ -2.39
ATG41Q12048 WIP1YDR374W-A 270 nt0.14□□□□□ -2.39
ATG41Q12048 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.14□□□□□ -2.39
ATG41Q12048 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.14□□□□□ -2.39
ATG41Q12048 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.14□□□□□ -2.39
ATG41Q12048 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.14□□□□□ -2.39
ATG41Q12048 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.14□□□□□ -2.39
ATG41Q12048 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.14□□□□□ -2.39
ATG41Q12048 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.14□□□□□ -2.39
ATG41Q12048 YFL012WYFL012W 447 nt0.14□□□□□ -2.39
ATG41Q12048 YLR269CYLR269C 351 nt0.14□□□□□ -2.39
ATG41Q12048 PBI2YNL015W 228 nt0.14□□□□□ -2.39
ATG41Q12048 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.13□□□□□ -2.39
ATG41Q12048 YAP6YDR259C 1152 nt0.13□□□□□ -2.39
ATG41Q12048 SDH7YDR511W 402 nt0.13□□□□□ -2.39
ATG41Q12048 GPI15YNL038W 690 nt0.13□□□□□ -2.39
ATG41Q12048 VIK1YPL253C 1944 nt0.13□□□□□ -2.39
ATG41Q12048 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.12□□□□□ -2.39
ATG41Q12048 YBR206WYBR206W 324 nt0.12□□□□□ -2.39
ATG41Q12048 YDL011CYDL011C 324 nt0.11□□□□□ -2.39
ATG41Q12048 RPF1YHR088W 888 nt0.11□□□□□ -2.39
ATG41Q12048 YBL071CYBL071C 309 nt0.11□□□□□ -2.39
ATG41Q12048 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.11□□□□□ -2.39
ATG41Q12048 MLP1YKR095W 5628 nt0.11□□□□□ -2.39
ATG41Q12048 TRS65YGR166W 1683 nt0.11□□□□□ -2.39
ATG41Q12048 ASE1YOR058C 2658 nt0.1□□□□□ -2.39
ATG41Q12048 MAM33YIL070C 801 nt0.1□□□□□ -2.39
ATG41Q12048 YJR011CYJR011C 786 nt0.1□□□□□ -2.39
ATG41Q12048 PTP2YOR208W 2253 nt0.1□□□□□ -2.39
ATG41Q12048 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.09□□□□□ -2.39
ATG41Q12048 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.09□□□□□ -2.4
ATG41Q12048 RPS20YHL015W 366 nt0.09□□□□□ -2.4
ATG41Q12048 PAA1YDR071C 576 nt0.08□□□□□ -2.4
ATG41Q12048 YHL041WYHL041W 450 nt0.08□□□□□ -2.4
ATG41Q12048 YKL123WYKL123W 381 nt0.08□□□□□ -2.4
ATG41Q12048 YML108WYML108W 318 nt0.08□□□□□ -2.4
ATG41Q12048 SPO21YOL091W 1830 nt0.08□□□□□ -2.4
ATG41Q12048 COX5BYIL111W 456 nt0.07□□□□□ -2.4
ATG41Q12048 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.07□□□□□ -2.4
ATG41Q12048 OST4YDL232W 111 nt0.06□□□□□ -2.4
ATG41Q12048 YLR287CYLR287C 1068 nt0.06□□□□□ -2.4
ATG41Q12048 YNL058CYNL058C 951 nt0.06□□□□□ -2.4
ATG41Q12048 YNL319WYNL319W 441 nt0.06□□□□□ -2.4
ATG41Q12048 YPL229WYPL229W 621 nt0.06□□□□□ -2.4
ATG41Q12048 PRP5YBR237W 2550 nt0.05□□□□□ -2.4
ATG41Q12048 YOL014WYOL014W 375 nt0.05□□□□□ -2.4
ATG41Q12048 SEC8YPR055W 3198 nt0.04□□□□□ -2.4
ATG41Q12048 NIP100YPL174C 2607 nt0.04□□□□□ -2.4
ATG41Q12048 EAF6YJR082C 342 nt0.04□□□□□ -2.4
ATG41Q12048 ZEO1YOL109W 342 nt0.04□□□□□ -2.4
ATG41Q12048 STE5YDR103W 2754 nt0.04□□□□□ -2.4
ATG41Q12048 BIR1YJR089W 2865 nt0.04□□□□□ -2.4
ATG41Q12048 MLP2YIL149C 5040 nt0.03□□□□□ -2.4
ATG41Q12048 PRP42YDR235W 1635 nt0.03□□□□□ -2.4
ATG41Q12048 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.03□□□□□ -2.4
ATG41Q12048 YNL211CYNL211C 261 nt0.03□□□□□ -2.4
ATG41Q12048 IQG1YPL242C 4488 nt0.03□□□□□ -2.4
ATG41Q12048 ESP1YGR098C 4893 nt0.03□□□□□ -2.41
ATG41Q12048 ATG31YDR022C 591 nt0.02□□□□□ -2.41
ATG41Q12048 YHR125WYHR125W 306 nt0.02□□□□□ -2.41
ATG41Q12048 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.02□□□□□ -2.41
ATG41Q12048 COX12YLR038C 252 nt0.02□□□□□ -2.41
ATG41Q12048 YMR321CYMR321C 318 nt0.02□□□□□ -2.41
ATG41Q12048 HAL9YOL089C 3093 nt0.02□□□□□ -2.41
ATG41Q12048 YLR171WYLR171W 390 nt0.01□□□□□ -2.41
ATG41Q12048 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.01□□□□□ -2.41
ATG41Q12048 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.01□□□□□ -2.41
ATG41Q12048 snR78snR78 87 nt0□□□□□ -2.41
ATG41Q12048 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0□□□□□ -2.41
ATG41Q12048 YKL083WYKL083W 615 nt0□□□□□ -2.41
ATG41Q12048 AIM29YKR074W 468 nt0□□□□□ -2.41
ATG41Q12048 ORC3YLL004W 1851 nt0□□□□□ -2.41
ATG41Q12048 DIE2YGR227W 1578 nt-0.01□□□□□ -2.41
ATG41Q12048 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt-0.01□□□□□ -2.41
ATG41Q12048 RCO1YMR075W 2055 nt-0.02□□□□□ -2.41
ATG41Q12048 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt-0.02□□□□□ -2.41
ATG41Q12048 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt-0.03□□□□□ -2.41
ATG41Q12048 RPS26AYGL189C 360 nt-0.04□□□□□ -2.42
ATG41Q12048 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt-0.04□□□□□ -2.42
ATG41Q12048 YOR345CYOR345C 351 nt-0.04□□□□□ -2.42
ATG41Q12048 LEE1YPL054W 906 nt-0.04□□□□□ -2.42
ATG41Q12048 YER078W-AYER078W-A 165 nt-0.05□□□□□ -2.42
ATG41Q12048 YML007C-AYML007C-A 111 nt-0.05□□□□□ -2.42
ATG41Q12048 THO2YNL139C 4794 nt-0.06□□□□□ -2.42
ATG41Q12048 CBS1YDL069C 690 nt-0.06□□□□□ -2.42
ATG41Q12048 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt-0.06□□□□□ -2.42
ATG41Q12048 QCR9YGR183C 201 nt-0.06□□□□□ -2.42
ATG41Q12048 YHR130CYHR130C 336 nt-0.06□□□□□ -2.42
ATG41Q12048 STE18YJR086W 333 nt-0.06□□□□□ -2.42
ATG41Q12048 YAR047CYAR047C 321 nt-0.06□□□□□ -2.42
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