Protein–RNA interactions for Protein: Q12042

YPL162C, Vacuolar membrane protein YPL162C, yeastyeast

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL162CQ12042 YJR011CYJR011C 786 nt0.51□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 YKL083WYKL083W 615 nt0.51□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 PAC1YOR269W 1485 nt0.51□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 YBR206WYBR206W 324 nt0.51□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 UTP20YBL004W 7482 nt0.51□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 NIP100YPL174C 2607 nt0.51□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 PCF11YDR228C 1881 nt0.5□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 RPS20YHL015W 366 nt0.5□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.5□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.5□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.5□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.5□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.5□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.5□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.5□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.5□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.5□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.5□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.5□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 RPS24BYIL069C 408 nt0.5□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 YPL229WYPL229W 621 nt0.5□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 YPL261CYPL261C 309 nt0.5□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 YMR160WYMR160W 2451 nt0.49□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 PKH2YOL100W 3246 nt0.49□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 STF2YGR008C 255 nt0.49□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 ECM12YHR021W-A 456 nt0.49□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.49□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 YLR434CYLR434C 384 nt0.49□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 YOR282WYOR282W 321 nt0.49□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 YLL007CYLL007C 1998 nt0.48□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 YML002WYML002W 2214 nt0.48□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 ATG31YDR022C 591 nt0.48□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 YDR344CYDR344C 444 nt0.48□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 YAR047CYAR047C 321 nt0.48□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 RPL38YLR325C 237 nt0.48□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 YLR456WYLR456W 615 nt0.48□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 INP2YMR163C 2118 nt0.48□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 MCM10YIL150C 1716 nt0.47□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 MAM33YIL070C 801 nt0.47□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 ASE1YOR058C 2658 nt0.47□□□□□ -2.33
YPL162CQ12042 YCK3YER123W 1575 nt0.45□□□□□ -2.34
YPL162CQ12042 NOP9YJL010C 2001 nt0.45□□□□□ -2.34
YPL162CQ12042 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.45□□□□□ -2.34
YPL162CQ12042 OST1YJL002C 1431 nt0.45□□□□□ -2.34
YPL162CQ12042 PMP1YCR024C-A 123 nt0.44□□□□□ -2.34
YPL162CQ12042 YDR426CYDR426C 378 nt0.44□□□□□ -2.34
YPL162CQ12042 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.44□□□□□ -2.34
YPL162CQ12042 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.44□□□□□ -2.34
YPL162CQ12042 YNL058CYNL058C 951 nt0.44□□□□□ -2.34
YPL162CQ12042 HUG1YML058W-A 207 nt0.43□□□□□ -2.34
YPL162CQ12042 YPL185WYPL185W 396 nt0.43□□□□□ -2.34
YPL162CQ12042 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.43□□□□□ -2.34
YPL162CQ12042 CHS6YJL099W 2241 nt0.43□□□□□ -2.34
YPL162CQ12042 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.42□□□□□ -2.34
YPL162CQ12042 CSN9YDR179C 489 nt0.41□□□□□ -2.34
YPL162CQ12042 YER079WYER079W 633 nt0.41□□□□□ -2.34
YPL162CQ12042 YIR044CYIR044C 186 nt0.41□□□□□ -2.34
YPL162CQ12042 YJR157WYJR157W 363 nt0.41□□□□□ -2.34
YPL162CQ12042 RPS30BYOR182C 192 nt0.41□□□□□ -2.34
YPL162CQ12042 CUL3YGR003W 2235 nt0.41□□□□□ -2.34
YPL162CQ12042 FMP27YLR454W 7887 nt0.4□□□□□ -2.35
YPL162CQ12042 OLI1Q0130 231 nt0.4□□□□□ -2.35
YPL162CQ12042 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.4□□□□□ -2.35
YPL162CQ12042 PRM3YPL192C 402 nt0.4□□□□□ -2.35
YPL162CQ12042 NPR2YEL062W 1848 nt0.4□□□□□ -2.35
YPL162CQ12042 YLR202CYLR202C 327 nt0.39□□□□□ -2.35
YPL162CQ12042 INA22YIR024C 651 nt0.38□□□□□ -2.35
YPL162CQ12042 YJL007CYJL007C 315 nt0.38□□□□□ -2.35
YPL162CQ12042 YLR334CYLR334C 381 nt0.38□□□□□ -2.35
YPL162CQ12042 BSC3YLR465C 309 nt0.38□□□□□ -2.35
YPL162CQ12042 YPL205CYPL205C 345 nt0.38□□□□□ -2.35
YPL162CQ12042 YER137W-AYER137W-A 306 nt0.36□□□□□ -2.35
YPL162CQ12042 YNL211CYNL211C 261 nt0.36□□□□□ -2.35
YPL162CQ12042 YOR218CYOR218C 420 nt0.36□□□□□ -2.35
YPL162CQ12042 YPL044CYPL044C 549 nt0.36□□□□□ -2.35
YPL162CQ12042 YSP1YHR155W 3687 nt0.35□□□□□ -2.35
YPL162CQ12042 VPS20YMR077C 666 nt0.35□□□□□ -2.35
YPL162CQ12042 Q0017Q0017 162 nt0.35□□□□□ -2.35
YPL162CQ12042 YBR285WYBR285W 435 nt0.35□□□□□ -2.35
YPL162CQ12042 ULP2YIL031W 3105 nt0.35□□□□□ -2.35
YPL162CQ12042 FYV10YIL097W 1551 nt0.34□□□□□ -2.36
YPL162CQ12042 TAR1YLR154W-C 375 nt0.34□□□□□ -2.36
YPL162CQ12042 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.34□□□□□ -2.36
YPL162CQ12042 YPL068CYPL068C 882 nt0.34□□□□□ -2.36
YPL162CQ12042 PTP2YOR208W 2253 nt0.33□□□□□ -2.36
YPL162CQ12042 RPL26BYGR034W 384 nt0.33□□□□□ -2.36
YPL162CQ12042 YHR138CYHR138C 345 nt0.33□□□□□ -2.36
YPL162CQ12042 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.33□□□□□ -2.36
YPL162CQ12042 YJL120WYJL120W 324 nt0.33□□□□□ -2.36
YPL162CQ12042 SGF11YPL047W 300 nt0.33□□□□□ -2.36
YPL162CQ12042 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.33□□□□□ -2.36
YPL162CQ12042 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.32□□□□□ -2.36
YPL162CQ12042 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0.32□□□□□ -2.36
YPL162CQ12042 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.32□□□□□ -2.36
YPL162CQ12042 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt0.32□□□□□ -2.36
YPL162CQ12042 YPL225WYPL225W 441 nt0.32□□□□□ -2.36
YPL162CQ12042 SPO21YOL091W 1830 nt0.31□□□□□ -2.36
YPL162CQ12042 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.31□□□□□ -2.36
YPL162CQ12042 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.31□□□□□ -2.36
YPL162CQ12042 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.31□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 80.4 ms