Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc8a1P70414 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc8a1P70414 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc8a1P70414 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc8a1P70414 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc8a1P70414 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc8a1P70414 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc8a1P70414 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc8a1P70414 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc8a1P70414 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc8a1P70414 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc8a1P70414 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc8a1P70414 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc8a1P70414 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc8a1P70414 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc8a1P70414 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc8a1P70414 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc8a1P70414 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc8a1P70414 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc8a1P70414 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc8a1P70414 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc8a1P70414 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc8a1P70414 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc8a1P70414 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc8a1P70414 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc8a1P70414 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc8a1P70414 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc8a1P70414 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc8a1P70414 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc8a1P70414 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc8a1P70414 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc8a1P70414 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc8a1P70414 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms