Protein–RNA interactions for Protein: P53819

YRF1-6, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 6, yeastyeast

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Length 1,859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-6P53819 YPR096CYPR096C 303 nt-0.26□□□□□ -2.45
YRF1-6P53819 YDR344CYDR344C 444 nt-0.27□□□□□ -2.45
YRF1-6P53819 CWC23YGL128C 852 nt-0.27□□□□□ -2.45
YRF1-6P53819 SDS22YKL193C 1017 nt-0.27□□□□□ -2.45
YRF1-6P53819 IRC16YPR038W 360 nt-0.27□□□□□ -2.45
YRF1-6P53819 PTP2YOR208W 2253 nt-0.27□□□□□ -2.45
YRF1-6P53819 RPS27AYKL156W 249 nt-0.27□□□□□ -2.45
YRF1-6P53819 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt-0.27□□□□□ -2.45
YRF1-6P53819 DCP1YOL149W 696 nt-0.27□□□□□ -2.45
YRF1-6P53819 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt-0.28□□□□□ -2.45
YRF1-6P53819 YDL187CYDL187C 330 nt-0.29□□□□□ -2.46
YRF1-6P53819 snR8snR8 190 nt-0.29□□□□□ -2.46
YRF1-6P53819 YFR057WYFR057W 456 nt-0.29□□□□□ -2.46
YRF1-6P53819 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt-0.29□□□□□ -2.46
YRF1-6P53819 YBR206WYBR206W 324 nt-0.29□□□□□ -2.46
YRF1-6P53819 SOV1YMR066W 2697 nt-0.29□□□□□ -2.46
YRF1-6P53819 YDR220CYDR220C 294 nt-0.3□□□□□ -2.46
YRF1-6P53819 YPL225WYPL225W 441 nt-0.3□□□□□ -2.46
YRF1-6P53819 YDR269CYDR269C 324 nt-0.31□□□□□ -2.46
YRF1-6P53819 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt-0.31□□□□□ -2.46
YRF1-6P53819 YER076W-AYER076W-A 348 nt-0.31□□□□□ -2.46
YRF1-6P53819 EMC4YGL231C 573 nt-0.31□□□□□ -2.46
YRF1-6P53819 PBI2YNL015W 228 nt-0.31□□□□□ -2.46
YRF1-6P53819 NIP1YMR309C 2439 nt-0.31□□□□□ -2.46
YRF1-6P53819 BUD26YDR241W 288 nt-0.32□□□□□ -2.46
YRF1-6P53819 YLR217WYLR217W 324 nt-0.32□□□□□ -2.46
YRF1-6P53819 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt-0.32□□□□□ -2.46
YRF1-6P53819 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt-0.32□□□□□ -2.46
YRF1-6P53819 UBS1YBR165W 834 nt-0.32□□□□□ -2.46
YRF1-6P53819 snR5snR5 204 nt-0.33□□□□□ -2.46
YRF1-6P53819 ILM1YJR118C 612 nt-0.33□□□□□ -2.46
YRF1-6P53819 EFR3YMR212C 2349 nt-0.33□□□□□ -2.46
YRF1-6P53819 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt-0.33□□□□□ -2.46
YRF1-6P53819 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt-0.34□□□□□ -2.46
YRF1-6P53819 YAP6YDR259C 1152 nt-0.35□□□□□ -2.46
YRF1-6P53819 HUR1YGL168W 333 nt-0.35□□□□□ -2.46
YRF1-6P53819 MCM10YIL150C 1716 nt-0.35□□□□□ -2.47
YRF1-6P53819 OST4YDL232W 111 nt-0.36□□□□□ -2.47
YRF1-6P53819 RPS26AYGL189C 360 nt-0.36□□□□□ -2.47
YRF1-6P53819 YGR115CYGR115C 780 nt-0.37□□□□□ -2.47
YRF1-6P53819 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt-0.37□□□□□ -2.47
YRF1-6P53819 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.37□□□□□ -2.47
YRF1-6P53819 YKU70YMR284W 1809 nt-0.37□□□□□ -2.47
YRF1-6P53819 YER138W-AYER138W-A 105 nt-0.37□□□□□ -2.47
YRF1-6P53819 YKL202WYKL202W 582 nt-0.37□□□□□ -2.47
YRF1-6P53819 ECM9YKR004C 1134 nt-0.38□□□□□ -2.47
YRF1-6P53819 PAA1YDR071C 576 nt-0.39□□□□□ -2.47
YRF1-6P53819 YGL015CYGL015C 393 nt-0.39□□□□□ -2.47
YRF1-6P53819 YJR011CYJR011C 786 nt-0.39□□□□□ -2.47
YRF1-6P53819 YNL146WYNL146W 303 nt-0.39□□□□□ -2.47
YRF1-6P53819 YGL239CYGL239C 315 nt-0.39□□□□□ -2.47
YRF1-6P53819 NFU1YKL040C 771 nt-0.39□□□□□ -2.47
YRF1-6P53819 YBL062WYBL062W 381 nt-0.39□□□□□ -2.47
YRF1-6P53819 snR128snR128 126 nt-0.39□□□□□ -2.47
YRF1-6P53819 YEL073CYEL073C 324 nt-0.4□□□□□ -2.47
YRF1-6P53819 YPL261CYPL261C 309 nt-0.4□□□□□ -2.47
YRF1-6P53819 snR51snR51 107 nt-0.4□□□□□ -2.47
YRF1-6P53819 TIM13YGR181W 318 nt-0.41□□□□□ -2.47
YRF1-6P53819 MRPL32YCR003W 552 nt-0.41□□□□□ -2.48
YRF1-6P53819 RAD61YDR014W 1944 nt-0.42□□□□□ -2.48
YRF1-6P53819 YLR171WYLR171W 390 nt-0.42□□□□□ -2.48
YRF1-6P53819 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt-0.43□□□□□ -2.48
YRF1-6P53819 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt-0.43□□□□□ -2.48
YRF1-6P53819 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt-0.43□□□□□ -2.48
YRF1-6P53819 YJR141WYJR141W 1044 nt-0.44□□□□□ -2.48
YRF1-6P53819 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt-0.44□□□□□ -2.48
YRF1-6P53819 SNU56YDR240C 1479 nt-0.44□□□□□ -2.48
YRF1-6P53819 YDR210WYDR210W 228 nt-0.44□□□□□ -2.48
YRF1-6P53819 YGR228WYGR228W 345 nt-0.44□□□□□ -2.48
YRF1-6P53819 YLR198CYLR198C 360 nt-0.44□□□□□ -2.48
YRF1-6P53819 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt-0.45□□□□□ -2.48
YRF1-6P53819 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt-0.45□□□□□ -2.48
YRF1-6P53819 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt-0.45□□□□□ -2.48
YRF1-6P53819 SEC10YLR166C 2616 nt-0.45□□□□□ -2.48
YRF1-6P53819 SEM1YDR363W-A 270 nt-0.46□□□□□ -2.48
YRF1-6P53819 YPT6YLR262C 648 nt-0.46□□□□□ -2.48
YRF1-6P53819 YPR039WYPR039W 336 nt-0.46□□□□□ -2.48
YRF1-6P53819 COY1YKL179C 2040 nt-0.47□□□□□ -2.48
YRF1-6P53819 YER175W-AYER175W-A 165 nt-0.47□□□□□ -2.48
YRF1-6P53819 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt-0.47□□□□□ -2.48
YRF1-6P53819 SPO21YOL091W 1830 nt-0.48□□□□□ -2.49
YRF1-6P53819 RPS20YHL015W 366 nt-0.48□□□□□ -2.49
YRF1-6P53819 YIR044CYIR044C 186 nt-0.48□□□□□ -2.49
YRF1-6P53819 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-0.48□□□□□ -2.49
YRF1-6P53819 YOL029CYOL029C 606 nt-0.48□□□□□ -2.49
YRF1-6P53819 ATG31YDR022C 591 nt-0.49□□□□□ -2.49
YRF1-6P53819 YML108WYML108W 318 nt-0.49□□□□□ -2.49
YRF1-6P53819 TSC3YBR058C-A 243 nt-0.49□□□□□ -2.49
YRF1-6P53819 YHL041WYHL041W 450 nt-0.5□□□□□ -2.49
YRF1-6P53819 APQ13YJL075C 417 nt-0.5□□□□□ -2.49
YRF1-6P53819 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt-0.5□□□□□ -2.49
YRF1-6P53819 snR72snR72 98 nt-0.51□□□□□ -2.49
YRF1-6P53819 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.52□□□□□ -2.49
YRF1-6P53819 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.52□□□□□ -2.49
YRF1-6P53819 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.52□□□□□ -2.49
YRF1-6P53819 snR9snR9 187 nt-0.52□□□□□ -2.49
YRF1-6P53819 YER135CYER135C 393 nt-0.52□□□□□ -2.49
YRF1-6P53819 ECL1YGR146C 636 nt-0.52□□□□□ -2.49
YRF1-6P53819 POP7YBR167C 423 nt-0.52□□□□□ -2.49
YRF1-6P53819 DIE2YGR227W 1578 nt-0.53□□□□□ -2.49
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