Protein–RNA interactions for Protein: P40356

PGD1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 3, yeastyeast

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PGD1P40356 MRPL50YNR022C 420 nt0.5□□□□□ -2.33
PGD1P40356 NIP100YPL174C 2607 nt0.5□□□□□ -2.33
PGD1P40356 YDR344CYDR344C 444 nt0.49□□□□□ -2.33
PGD1P40356 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.49□□□□□ -2.33
PGD1P40356 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.49□□□□□ -2.33
PGD1P40356 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.49□□□□□ -2.33
PGD1P40356 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.49□□□□□ -2.33
PGD1P40356 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.49□□□□□ -2.33
PGD1P40356 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.49□□□□□ -2.33
PGD1P40356 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.49□□□□□ -2.33
PGD1P40356 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.49□□□□□ -2.33
PGD1P40356 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.49□□□□□ -2.33
PGD1P40356 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.49□□□□□ -2.33
PGD1P40356 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.49□□□□□ -2.33
PGD1P40356 HUG1YML058W-A 207 nt0.49□□□□□ -2.33
PGD1P40356 ISF1YMR081C 1017 nt0.49□□□□□ -2.33
PGD1P40356 ATP19YOL077W-A 207 nt0.49□□□□□ -2.33
PGD1P40356 YBR064WYBR064W 429 nt0.49□□□□□ -2.33
PGD1P40356 PCF11YDR228C 1881 nt0.49□□□□□ -2.33
PGD1P40356 UTP10YJL109C 5310 nt0.49□□□□□ -2.33
PGD1P40356 YSP1YHR155W 3687 nt0.49□□□□□ -2.33
PGD1P40356 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.48□□□□□ -2.33
PGD1P40356 YJR011CYJR011C 786 nt0.48□□□□□ -2.33
PGD1P40356 YAR047CYAR047C 321 nt0.48□□□□□ -2.33
PGD1P40356 YNL058CYNL058C 951 nt0.48□□□□□ -2.33
PGD1P40356 NOP9YJL010C 2001 nt0.47□□□□□ -2.33
PGD1P40356 PMP1YCR024C-A 123 nt0.47□□□□□ -2.33
PGD1P40356 ATG31YDR022C 591 nt0.47□□□□□ -2.33
PGD1P40356 ECM12YHR021W-A 456 nt0.47□□□□□ -2.33
PGD1P40356 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.47□□□□□ -2.33
PGD1P40356 MAM33YIL070C 801 nt0.47□□□□□ -2.33
PGD1P40356 INA22YIR024C 651 nt0.47□□□□□ -2.33
PGD1P40356 YOR029WYOR029W 336 nt0.47□□□□□ -2.33
PGD1P40356 YOR282WYOR282W 321 nt0.47□□□□□ -2.33
PGD1P40356 YBR206WYBR206W 324 nt0.47□□□□□ -2.33
PGD1P40356 CUL3YGR003W 2235 nt0.47□□□□□ -2.33
PGD1P40356 OST1YJL002C 1431 nt0.47□□□□□ -2.33
PGD1P40356 RPS20YHL015W 366 nt0.46□□□□□ -2.34
PGD1P40356 YIR044CYIR044C 186 nt0.46□□□□□ -2.34
PGD1P40356 RPL38YLR325C 237 nt0.46□□□□□ -2.34
PGD1P40356 RPS30BYOR182C 192 nt0.46□□□□□ -2.34
PGD1P40356 ASE1YOR058C 2658 nt0.46□□□□□ -2.34
PGD1P40356 YCK3YER123W 1575 nt0.45□□□□□ -2.34
PGD1P40356 YLL007CYLL007C 1998 nt0.45□□□□□ -2.34
PGD1P40356 MCM10YIL150C 1716 nt0.45□□□□□ -2.34
PGD1P40356 CHS6YJL099W 2241 nt0.45□□□□□ -2.34
PGD1P40356 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.44□□□□□ -2.34
PGD1P40356 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.44□□□□□ -2.34
PGD1P40356 NPR2YEL062W 1848 nt0.43□□□□□ -2.34
PGD1P40356 RPS24BYIL069C 408 nt0.43□□□□□ -2.34
PGD1P40356 OLI1Q0130 231 nt0.42□□□□□ -2.34
PGD1P40356 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.42□□□□□ -2.34
PGD1P40356 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.41□□□□□ -2.34
PGD1P40356 YPL044CYPL044C 549 nt0.41□□□□□ -2.34
PGD1P40356 BSC3YLR465C 309 nt0.4□□□□□ -2.35
PGD1P40356 PTP2YOR208W 2253 nt0.4□□□□□ -2.35
PGD1P40356 YDR426CYDR426C 378 nt0.39□□□□□ -2.35
PGD1P40356 YLR456WYLR456W 615 nt0.39□□□□□ -2.35
PGD1P40356 ESP1YGR098C 4893 nt0.39□□□□□ -2.35
PGD1P40356 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.38□□□□□ -2.35
PGD1P40356 YLR434CYLR434C 384 nt0.37□□□□□ -2.35
PGD1P40356 YPL185WYPL185W 396 nt0.37□□□□□ -2.35
PGD1P40356 SEC8YPR055W 3198 nt0.37□□□□□ -2.35
PGD1P40356 YMR160WYMR160W 2451 nt0.37□□□□□ -2.35
PGD1P40356 RPL26BYGR034W 384 nt0.36□□□□□ -2.35
PGD1P40356 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.36□□□□□ -2.35
PGD1P40356 FMP27YLR454W 7887 nt0.36□□□□□ -2.35
PGD1P40356 FYV10YIL097W 1551 nt0.35□□□□□ -2.35
PGD1P40356 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.34□□□□□ -2.36
PGD1P40356 YOR218CYOR218C 420 nt0.34□□□□□ -2.36
PGD1P40356 HAL9YOL089C 3093 nt0.33□□□□□ -2.36
PGD1P40356 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.33□□□□□ -2.36
PGD1P40356 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.33□□□□□ -2.36
PGD1P40356 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.33□□□□□ -2.36
PGD1P40356 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.33□□□□□ -2.36
PGD1P40356 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.33□□□□□ -2.36
PGD1P40356 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.33□□□□□ -2.36
PGD1P40356 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.33□□□□□ -2.36
PGD1P40356 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.33□□□□□ -2.36
PGD1P40356 YNL211CYNL211C 261 nt0.33□□□□□ -2.36
PGD1P40356 SPO21YOL091W 1830 nt0.32□□□□□ -2.36
PGD1P40356 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.32□□□□□ -2.36
PGD1P40356 ABF2YMR072W 552 nt0.32□□□□□ -2.36
PGD1P40356 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.32□□□□□ -2.36
PGD1P40356 PAA1YDR071C 576 nt0.31□□□□□ -2.36
PGD1P40356 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.31□□□□□ -2.36
PGD1P40356 PCC1YKR095W-A 267 nt0.31□□□□□ -2.36
PGD1P40356 YLR334CYLR334C 381 nt0.31□□□□□ -2.36
PGD1P40356 YOR053WYOR053W 342 nt0.31□□□□□ -2.36
PGD1P40356 YPL068CYPL068C 882 nt0.31□□□□□ -2.36
PGD1P40356 BEM3YPL115C 3387 nt0.31□□□□□ -2.36
PGD1P40356 PRP5YBR237W 2550 nt0.3□□□□□ -2.36
PGD1P40356 YJL007CYJL007C 315 nt0.3□□□□□ -2.36
PGD1P40356 CSN9YDR179C 489 nt0.29□□□□□ -2.36
PGD1P40356 SBH1YER087C-B 249 nt0.29□□□□□ -2.36
PGD1P40356 PAU12YGR294W 363 nt0.29□□□□□ -2.36
PGD1P40356 VPS20YMR077C 666 nt0.29□□□□□ -2.36
PGD1P40356 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.29□□□□□ -2.36
PGD1P40356 HMRA2YCR096C 360 nt0.28□□□□□ -2.36
PGD1P40356 TAR1YLR154W-C 375 nt0.28□□□□□ -2.36
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