Protein–RNA interactions for Protein: P40317

SOK1, Protein SOK1, yeastyeast

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SOK1P40317 RPB10YOR210W 213 nt0.48□□□□□ -2.33
SOK1P40317 YOR218CYOR218C 420 nt0.48□□□□□ -2.33
SOK1P40317 BFR2YDR299W 1605 nt0.47□□□□□ -2.33
SOK1P40317 CBS1YDL069C 690 nt0.47□□□□□ -2.33
SOK1P40317 ALG13YGL047W 609 nt0.47□□□□□ -2.33
SOK1P40317 YHL041WYHL041W 450 nt0.47□□□□□ -2.33
SOK1P40317 YLR171WYLR171W 390 nt0.47□□□□□ -2.33
SOK1P40317 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.47□□□□□ -2.33
SOK1P40317 snR41snR41 95 nt0.47□□□□□ -2.33
SOK1P40317 WAR1YML076C 2835 nt0.47□□□□□ -2.33
SOK1P40317 YKL202WYKL202W 582 nt0.46□□□□□ -2.34
SOK1P40317 YLR101CYLR101C 396 nt0.46□□□□□ -2.34
SOK1P40317 YNL303WYNL303W 348 nt0.46□□□□□ -2.34
SOK1P40317 YOL160WYOL160W 342 nt0.46□□□□□ -2.34
SOK1P40317 snR189snR189 189 nt0.46□□□□□ -2.34
SOK1P40317 snR51snR51 107 nt0.46□□□□□ -2.34
SOK1P40317 snR54snR54 86 nt0.46□□□□□ -2.34
SOK1P40317 YSP1YHR155W 3687 nt0.46□□□□□ -2.34
SOK1P40317 DIE2YGR227W 1578 nt0.45□□□□□ -2.34
SOK1P40317 SDH7YDR511W 402 nt0.45□□□□□ -2.34
SOK1P40317 RPL26AYLR344W 384 nt0.45□□□□□ -2.34
SOK1P40317 LOA1YPR139C 903 nt0.45□□□□□ -2.34
SOK1P40317 YAP6YDR259C 1152 nt0.44□□□□□ -2.34
SOK1P40317 ECL1YGR146C 636 nt0.44□□□□□ -2.34
SOK1P40317 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt0.44□□□□□ -2.34
SOK1P40317 ATP19YOL077W-A 207 nt0.44□□□□□ -2.34
SOK1P40317 RAD34YDR314C 2079 nt0.44□□□□□ -2.34
SOK1P40317 ULP2YIL031W 3105 nt0.43□□□□□ -2.34
SOK1P40317 GPG1YGL121C 381 nt0.43□□□□□ -2.34
SOK1P40317 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.43□□□□□ -2.34
SOK1P40317 IES4YOR189W 351 nt0.43□□□□□ -2.34
SOK1P40317 PKH2YOL100W 3246 nt0.43□□□□□ -2.34
SOK1P40317 PAN2YGL094C 3348 nt0.42□□□□□ -2.34
SOK1P40317 YHL042WYHL042W 453 nt0.42□□□□□ -2.34
SOK1P40317 YKL083WYKL083W 615 nt0.42□□□□□ -2.34
SOK1P40317 YPL261CYPL261C 309 nt0.42□□□□□ -2.34
SOK1P40317 YLL007CYLL007C 1998 nt0.42□□□□□ -2.34
SOK1P40317 TRS65YGR166W 1683 nt0.41□□□□□ -2.34
SOK1P40317 YDR344CYDR344C 444 nt0.41□□□□□ -2.34
SOK1P40317 YER006C-AYER006C-A 318 nt0.41□□□□□ -2.34
SOK1P40317 ISF1YMR081C 1017 nt0.41□□□□□ -2.34
SOK1P40317 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.41□□□□□ -2.34
SOK1P40317 MRPL50YNR022C 420 nt0.41□□□□□ -2.34
SOK1P40317 YPL229WYPL229W 621 nt0.41□□□□□ -2.34
SOK1P40317 YBR064WYBR064W 429 nt0.41□□□□□ -2.34
SOK1P40317 DBP6YNR038W 1890 nt0.41□□□□□ -2.34
SOK1P40317 PCF11YDR228C 1881 nt0.4□□□□□ -2.35
SOK1P40317 ECM12YHR021W-A 456 nt0.4□□□□□ -2.35
SOK1P40317 YJR011CYJR011C 786 nt0.4□□□□□ -2.35
SOK1P40317 YBR206WYBR206W 324 nt0.4□□□□□ -2.35
SOK1P40317 AI1Q0050 2505 nt0.4□□□□□ -2.35
SOK1P40317 INP2YMR163C 2118 nt0.4□□□□□ -2.35
SOK1P40317 NIP100YPL174C 2607 nt0.39□□□□□ -2.35
SOK1P40317 ISD11YER048W-A 285 nt0.39□□□□□ -2.35
SOK1P40317 RPS20YHL015W 366 nt0.39□□□□□ -2.35
SOK1P40317 YAR047CYAR047C 321 nt0.39□□□□□ -2.35
SOK1P40317 MCM10YIL150C 1716 nt0.38□□□□□ -2.35
SOK1P40317 ATG31YDR022C 591 nt0.38□□□□□ -2.35
SOK1P40317 MAM33YIL070C 801 nt0.38□□□□□ -2.35
SOK1P40317 NOP9YJL010C 2001 nt0.38□□□□□ -2.35
SOK1P40317 CHS6YJL099W 2241 nt0.37□□□□□ -2.35
SOK1P40317 PMP1YCR024C-A 123 nt0.37□□□□□ -2.35
SOK1P40317 RPS24BYIL069C 408 nt0.37□□□□□ -2.35
SOK1P40317 YNL058CYNL058C 951 nt0.37□□□□□ -2.35
SOK1P40317 ASE1YOR058C 2658 nt0.36□□□□□ -2.35
SOK1P40317 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.36□□□□□ -2.35
SOK1P40317 YLR434CYLR434C 384 nt0.35□□□□□ -2.35
SOK1P40317 CUL3YGR003W 2235 nt0.34□□□□□ -2.35
SOK1P40317 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.34□□□□□ -2.36
SOK1P40317 OLI1Q0130 231 nt0.34□□□□□ -2.36
SOK1P40317 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.34□□□□□ -2.36
SOK1P40317 ABF2YMR072W 552 nt0.34□□□□□ -2.36
SOK1P40317 YOR282WYOR282W 321 nt0.34□□□□□ -2.36
SOK1P40317 NPR2YEL062W 1848 nt0.34□□□□□ -2.36
SOK1P40317 YDR426CYDR426C 378 nt0.33□□□□□ -2.36
SOK1P40317 YIR044CYIR044C 186 nt0.33□□□□□ -2.36
SOK1P40317 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.33□□□□□ -2.36
SOK1P40317 YLR456WYLR456W 615 nt0.32□□□□□ -2.36
SOK1P40317 BSC3YLR465C 309 nt0.32□□□□□ -2.36
SOK1P40317 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.32□□□□□ -2.36
SOK1P40317 YPL044CYPL044C 549 nt0.32□□□□□ -2.36
SOK1P40317 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.31□□□□□ -2.36
SOK1P40317 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.3□□□□□ -2.36
SOK1P40317 YPL185WYPL185W 396 nt0.3□□□□□ -2.36
SOK1P40317 RPL26BYGR034W 384 nt0.29□□□□□ -2.36
SOK1P40317 YMR321CYMR321C 318 nt0.29□□□□□ -2.36
SOK1P40317 PTP2YOR208W 2253 nt0.28□□□□□ -2.36
SOK1P40317 CSN9YDR179C 489 nt0.28□□□□□ -2.36
SOK1P40317 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.28□□□□□ -2.36
SOK1P40317 YNL211CYNL211C 261 nt0.28□□□□□ -2.36
SOK1P40317 FYV10YIL097W 1551 nt0.28□□□□□ -2.37
SOK1P40317 IQG1YPL242C 4488 nt0.27□□□□□ -2.37
SOK1P40317 BIR1YJR089W 2865 nt0.27□□□□□ -2.37
SOK1P40317 YLR334CYLR334C 381 nt0.27□□□□□ -2.37
SOK1P40317 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.26□□□□□ -2.37
SOK1P40317 YJL007CYJL007C 315 nt0.26□□□□□ -2.37
SOK1P40317 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.26□□□□□ -2.37
SOK1P40317 YPL068CYPL068C 882 nt0.26□□□□□ -2.37
SOK1P40317 MLP2YIL149C 5040 nt0.25□□□□□ -2.37
SOK1P40317 SBH1YER087C-B 249 nt0.25□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 1161.9 ms