Protein–RNA interactions for Protein: P40202

CCS1, Superoxide dismutase 1 copper chaperone, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCS1P40202 RAD34YDR314C 2079 nt0.2□□□□□ -2.38
CCS1P40202 TIM13YGR181W 318 nt0.2□□□□□ -2.38
CCS1P40202 YBR064WYBR064W 429 nt0.2□□□□□ -2.38
CCS1P40202 EMC4YGL231C 573 nt0.19□□□□□ -2.38
CCS1P40202 RPL26AYLR344W 384 nt0.19□□□□□ -2.38
CCS1P40202 YPL261CYPL261C 309 nt0.19□□□□□ -2.38
CCS1P40202 BEM3YPL115C 3387 nt0.19□□□□□ -2.38
CCS1P40202 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.18□□□□□ -2.38
CCS1P40202 MCM10YIL150C 1716 nt0.18□□□□□ -2.38
CCS1P40202 ESP1YGR098C 4893 nt0.18□□□□□ -2.38
CCS1P40202 PET111YMR257C 2403 nt0.17□□□□□ -2.38
CCS1P40202 CUL3YGR003W 2235 nt0.17□□□□□ -2.38
CCS1P40202 YCR001WYCR001W 315 nt0.17□□□□□ -2.38
CCS1P40202 OLI1Q0130 231 nt0.17□□□□□ -2.38
CCS1P40202 YLR269CYLR269C 351 nt0.17□□□□□ -2.38
CCS1P40202 snR51snR51 107 nt0.17□□□□□ -2.38
CCS1P40202 ASE1YOR058C 2658 nt0.17□□□□□ -2.38
CCS1P40202 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.16□□□□□ -2.38
CCS1P40202 INP2YMR163C 2118 nt0.16□□□□□ -2.38
CCS1P40202 WIP1YDR374W-A 270 nt0.16□□□□□ -2.38
CCS1P40202 YGR290WYGR290W 444 nt0.16□□□□□ -2.38
CCS1P40202 PAU12YGR294W 363 nt0.16□□□□□ -2.38
CCS1P40202 NFU1YKL040C 771 nt0.16□□□□□ -2.38
CCS1P40202 FYV10YIL097W 1551 nt0.15□□□□□ -2.38
CCS1P40202 TRS65YGR166W 1683 nt0.15□□□□□ -2.39
CCS1P40202 GPI15YNL038W 690 nt0.15□□□□□ -2.39
CCS1P40202 YFL012WYFL012W 447 nt0.14□□□□□ -2.39
CCS1P40202 YIR044CYIR044C 186 nt0.14□□□□□ -2.39
CCS1P40202 STE5YDR103W 2754 nt0.14□□□□□ -2.39
CCS1P40202 SDH7YDR511W 402 nt0.13□□□□□ -2.39
CCS1P40202 RPF1YHR088W 888 nt0.13□□□□□ -2.39
CCS1P40202 VIK1YPL253C 1944 nt0.13□□□□□ -2.39
CCS1P40202 YAP6YDR259C 1152 nt0.12□□□□□ -2.39
CCS1P40202 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.12□□□□□ -2.39
CCS1P40202 YBR206WYBR206W 324 nt0.12□□□□□ -2.39
CCS1P40202 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.11□□□□□ -2.39
CCS1P40202 PBI2YNL015W 228 nt0.11□□□□□ -2.39
CCS1P40202 MAM33YIL070C 801 nt0.1□□□□□ -2.39
CCS1P40202 YJR011CYJR011C 786 nt0.1□□□□□ -2.39
CCS1P40202 YBL071CYBL071C 309 nt0.1□□□□□ -2.39
CCS1P40202 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.1□□□□□ -2.39
CCS1P40202 YPL185WYPL185W 396 nt0.1□□□□□ -2.39
CCS1P40202 YDL011CYDL011C 324 nt0.09□□□□□ -2.4
CCS1P40202 YHL041WYHL041W 450 nt0.09□□□□□ -2.4
CCS1P40202 YKL123WYKL123W 381 nt0.09□□□□□ -2.4
CCS1P40202 YML108WYML108W 318 nt0.09□□□□□ -2.4
CCS1P40202 YOL014WYOL014W 375 nt0.09□□□□□ -2.4
CCS1P40202 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.09□□□□□ -2.4
CCS1P40202 MLP2YIL149C 5040 nt0.08□□□□□ -2.4
CCS1P40202 QCR9YGR183C 201 nt0.08□□□□□ -2.4
CCS1P40202 YNL319WYNL319W 441 nt0.08□□□□□ -2.4
CCS1P40202 PTP2YOR208W 2253 nt0.08□□□□□ -2.4
CCS1P40202 SPO21YOL091W 1830 nt0.08□□□□□ -2.4
CCS1P40202 PAA1YDR071C 576 nt0.07□□□□□ -2.4
CCS1P40202 COX5BYIL111W 456 nt0.07□□□□□ -2.4
CCS1P40202 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.06□□□□□ -2.4
CCS1P40202 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.06□□□□□ -2.4
CCS1P40202 PRP5YBR237W 2550 nt0.06□□□□□ -2.4
CCS1P40202 OST4YDL232W 111 nt0.05□□□□□ -2.4
CCS1P40202 RPS20YHL015W 366 nt0.05□□□□□ -2.4
CCS1P40202 YLR287CYLR287C 1068 nt0.05□□□□□ -2.4
CCS1P40202 YMR321CYMR321C 318 nt0.05□□□□□ -2.4
CCS1P40202 YNL058CYNL058C 951 nt0.05□□□□□ -2.4
CCS1P40202 YPL229WYPL229W 621 nt0.05□□□□□ -2.4
CCS1P40202 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.04□□□□□ -2.4
CCS1P40202 YNL211CYNL211C 261 nt0.04□□□□□ -2.4
CCS1P40202 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.04□□□□□ -2.4
CCS1P40202 MLP1YKR095W 5628 nt0.04□□□□□ -2.4
CCS1P40202 ORC3YLL004W 1851 nt0.03□□□□□ -2.4
CCS1P40202 RCO1YMR075W 2055 nt0.03□□□□□ -2.4
CCS1P40202 EAF6YJR082C 342 nt0.03□□□□□ -2.4
CCS1P40202 YKL083WYKL083W 615 nt0.03□□□□□ -2.4
CCS1P40202 COX12YLR038C 252 nt0.03□□□□□ -2.4
CCS1P40202 ZEO1YOL109W 342 nt0.03□□□□□ -2.4
CCS1P40202 PRP42YDR235W 1635 nt0.02□□□□□ -2.41
CCS1P40202 YHR125WYHR125W 306 nt0.02□□□□□ -2.41
CCS1P40202 YLR171WYLR171W 390 nt0.02□□□□□ -2.41
CCS1P40202 SEC8YPR055W 3198 nt0.02□□□□□ -2.41
CCS1P40202 ATG31YDR022C 591 nt0.01□□□□□ -2.41
CCS1P40202 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt0.01□□□□□ -2.41
CCS1P40202 AIM29YKR074W 468 nt0.01□□□□□ -2.41
CCS1P40202 NIP100YPL174C 2607 nt0□□□□□ -2.41
CCS1P40202 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0□□□□□ -2.41
CCS1P40202 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0□□□□□ -2.41
CCS1P40202 YOR345CYOR345C 351 nt0□□□□□ -2.41
CCS1P40202 THO2YNL139C 4794 nt-0□□□□□ -2.41
CCS1P40202 DIE2YGR227W 1578 nt-0.01□□□□□ -2.41
CCS1P40202 snR78snR78 87 nt-0.01□□□□□ -2.41
CCS1P40202 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt-0.01□□□□□ -2.41
CCS1P40202 LEE1YPL054W 906 nt-0.01□□□□□ -2.41
CCS1P40202 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt-0.02□□□□□ -2.41
CCS1P40202 HAL9YOL089C 3093 nt-0.02□□□□□ -2.41
CCS1P40202 YOR053WYOR053W 342 nt-0.03□□□□□ -2.41
CCS1P40202 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt-0.03□□□□□ -2.41
CCS1P40202 YER078W-AYER078W-A 165 nt-0.04□□□□□ -2.42
CCS1P40202 RPS26AYGL189C 360 nt-0.04□□□□□ -2.42
CCS1P40202 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt-0.04□□□□□ -2.42
CCS1P40202 PCF11YDR228C 1881 nt-0.04□□□□□ -2.42
CCS1P40202 CBS1YDL069C 690 nt-0.05□□□□□ -2.42
CCS1P40202 YAR047CYAR047C 321 nt-0.05□□□□□ -2.42
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