Protein–RNA interactions for Protein: P21771

MRPS28, 37S ribosomal protein S28, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 286 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPS28	P21771	YMR290W-A	YMR290W-A	348 nt		0.53	□□□□□ -2.32
MRPS28	P21771	RAD34	YDR314C	2079 nt		0.53	□□□□□ -2.32
MRPS28	P21771	ISD11	YER048W-A	285 nt		0.52	□□□□□ -2.33
MRPS28	P21771	YBL008W-A	YBL008W-A	240 nt		0.52	□□□□□ -2.33
MRPS28	P21771	snR51	snR51	107 nt		0.52	□□□□□ -2.33
MRPS28	P21771	DBP6	YNR038W	1890 nt		0.52	□□□□□ -2.33
MRPS28	P21771	DIE2	YGR227W	1578 nt		0.5	□□□□□ -2.33
MRPS28	P21771	SDH7	YDR511W	402 nt		0.5	□□□□□ -2.33
MRPS28	P21771	snR54	snR54	86 nt		0.5	□□□□□ -2.33
MRPS28	P21771	UTP20	YBL004W	7482 nt		0.5	□□□□□ -2.33
MRPS28	P21771	PKH2	YOL100W	3246 nt		0.49	□□□□□ -2.33
MRPS28	P21771	NOP9	YJL010C	2001 nt		0.49	□□□□□ -2.33
MRPS28	P21771	NIP100	YPL174C	2607 nt		0.49	□□□□□ -2.33
MRPS28	P21771	CBS1	YDL069C	690 nt		0.49	□□□□□ -2.33
MRPS28	P21771	YHL041W	YHL041W	450 nt		0.49	□□□□□ -2.33
MRPS28	P21771	ECM12	YHR021W-A	456 nt		0.49	□□□□□ -2.33
MRPS28	P21771	YLR171W	YLR171W	390 nt		0.49	□□□□□ -2.33
MRPS28	P21771	PMP1	YCR024C-A	123 nt		0.48	□□□□□ -2.33
MRPS28	P21771	YEL050W-A	YEL050W-A	192 nt		0.48	□□□□□ -2.33
MRPS28	P21771	RPL38	YLR325C	237 nt		0.48	□□□□□ -2.33
MRPS28	P21771	YBR064W	YBR064W	429 nt		0.48	□□□□□ -2.33
MRPS28	P21771	YAP6	YDR259C	1152 nt		0.47	□□□□□ -2.33
MRPS28	P21771	YKL145W-A	YKL145W-A	93 nt		0.47	□□□□□ -2.33
MRPS28	P21771	YLR101C	YLR101C	396 nt		0.47	□□□□□ -2.33
MRPS28	P21771	TOM22	YNL131W	459 nt		0.47	□□□□□ -2.33
MRPS28	P21771	YPL229W	YPL229W	621 nt		0.47	□□□□□ -2.33
MRPS28	P21771	YCK3	YER123W	1575 nt		0.46	□□□□□ -2.34
MRPS28	P21771	ECL1	YGR146C	636 nt		0.46	□□□□□ -2.34
MRPS28	P21771	YHR063W-A	YHR063W-A	336 nt		0.46	□□□□□ -2.34
MRPS28	P21771	CHS6	YJL099W	2241 nt		0.46	□□□□□ -2.34
MRPS28	P21771	INP2	YMR163C	2118 nt		0.46	□□□□□ -2.34
MRPS28	P21771	YSP1	YHR155W	3687 nt		0.45	□□□□□ -2.34
MRPS28	P21771	ASE1	YOR058C	2658 nt		0.45	□□□□□ -2.34
MRPS28	P21771	YLL007C	YLL007C	1998 nt		0.45	□□□□□ -2.34
MRPS28	P21771	RPS20	YHL015W	366 nt		0.45	□□□□□ -2.34
MRPS28	P21771	YJR011C	YJR011C	786 nt		0.45	□□□□□ -2.34
MRPS28	P21771	RPL26A	YLR344W	384 nt		0.45	□□□□□ -2.34
MRPS28	P21771	MRPL50	YNR022C	420 nt		0.45	□□□□□ -2.34
MRPS28	P21771	YOL013W-B	YOL013W-B	291 nt		0.45	□□□□□ -2.34
MRPS28	P21771	YOR282W	YOR282W	321 nt		0.45	□□□□□ -2.34
MRPS28	P21771	YBR206W	YBR206W	324 nt		0.45	□□□□□ -2.34
MRPS28	P21771	ATG31	YDR022C	591 nt		0.44	□□□□□ -2.34
MRPS28	P21771	YDR344C	YDR344C	444 nt		0.44	□□□□□ -2.34
MRPS28	P21771	YKL083W	YKL083W	615 nt		0.44	□□□□□ -2.34
MRPS28	P21771	snR41	snR41	95 nt		0.44	□□□□□ -2.34
MRPS28	P21771	MAM33	YIL070C	801 nt		0.43	□□□□□ -2.34
MRPS28	P21771	YIR044C	YIR044C	186 nt		0.43	□□□□□ -2.34
MRPS28	P21771	ISF1	YMR081C	1017 nt		0.43	□□□□□ -2.34
MRPS28	P21771	MCM10	YIL150C	1716 nt		0.43	□□□□□ -2.34
MRPS28	P21771	YER006C-A	YER006C-A	318 nt		0.42	□□□□□ -2.34
MRPS28	P21771	YNL058C	YNL058C	951 nt		0.41	□□□□□ -2.34
MRPS28	P21771	ATP19	YOL077W-A	207 nt		0.41	□□□□□ -2.34
MRPS28	P21771	YOR218C	YOR218C	420 nt		0.41	□□□□□ -2.34
MRPS28	P21771	snR189	snR189	189 nt		0.41	□□□□□ -2.34
MRPS28	P21771	CUL3	YGR003W	2235 nt		0.41	□□□□□ -2.34
MRPS28	P21771	NPR2	YEL062W	1848 nt		0.41	□□□□□ -2.34
MRPS28	P21771	YAL016C-B	YAL016C-B	186 nt		0.4	□□□□□ -2.35
MRPS28	P21771	YAR047C	YAR047C	321 nt		0.4	□□□□□ -2.35
MRPS28	P21771	PCF11	YDR228C	1881 nt		0.39	□□□□□ -2.35
MRPS28	P21771	OLI1	Q0130	231 nt		0.39	□□□□□ -2.35
MRPS28	P21771	QCR9	YGR183C	201 nt		0.39	□□□□□ -2.35
MRPS28	P21771	BSC3	YLR465C	309 nt		0.39	□□□□□ -2.35
MRPS28	P21771	YOL014W	YOL014W	375 nt		0.39	□□□□□ -2.35
MRPS28	P21771	YPL044C	YPL044C	549 nt		0.39	□□□□□ -2.35
MRPS28	P21771	PAU12	YGR294W	363 nt		0.38	□□□□□ -2.35
MRPS28	P21771	YOR032W-A	YOR032W-A	201 nt		0.38	□□□□□ -2.35
MRPS28	P21771	YFR012W-A	YFR012W-A	87 nt		0.37	□□□□□ -2.35
MRPS28	P21771	RPS24B	YIL069C	408 nt		0.37	□□□□□ -2.35
MRPS28	P21771	YNL303W	YNL303W	348 nt		0.36	□□□□□ -2.35
MRPS28	P21771	YPL185W	YPL185W	396 nt		0.36	□□□□□ -2.35
MRPS28	P21771	YGR174W-A	YGR174W-A	87 nt		0.35	□□□□□ -2.35
MRPS28	P21771	YIL134C-A	YIL134C-A	204 nt		0.35	□□□□□ -2.35
MRPS28	P21771	YPR002C-A	YPR002C-A	198 nt		0.35	□□□□□ -2.35
MRPS28	P21771	FYV10	YIL097W	1551 nt		0.35	□□□□□ -2.35
MRPS28	P21771	ULP2	YIL031W	3105 nt		0.35	□□□□□ -2.35
MRPS28	P21771	TRS65	YGR166W	1683 nt		0.34	□□□□□ -2.35
MRPS28	P21771	YDR426C	YDR426C	378 nt		0.34	□□□□□ -2.36
MRPS28	P21771	RPL26B	YGR034W	384 nt		0.34	□□□□□ -2.36
MRPS28	P21771	YLR456W	YLR456W	615 nt		0.34	□□□□□ -2.36
MRPS28	P21771	YML007C-A	YML007C-A	111 nt		0.34	□□□□□ -2.36
MRPS28	P21771	AI1	Q0050	2505 nt		0.33	□□□□□ -2.36
MRPS28	P21771	FMP27	YLR454W	7887 nt		0.33	□□□□□ -2.36
MRPS28	P21771	ABF2	YMR072W	552 nt		0.33	□□□□□ -2.36
MRPS28	P21771	PTP2	YOR208W	2253 nt		0.33	□□□□□ -2.36
MRPS28	P21771	ESP1	YGR098C	4893 nt		0.31	□□□□□ -2.36
MRPS28	P21771	YLR434C	YLR434C	384 nt		0.31	□□□□□ -2.36
MRPS28	P21771	PRP5	YBR237W	2550 nt		0.3	□□□□□ -2.36
MRPS28	P21771	YNL211C	YNL211C	261 nt		0.3	□□□□□ -2.36
MRPS28	P21771	HAL9	YOL089C	3093 nt		0.29	□□□□□ -2.36
MRPS28	P21771	YJL127W-A	YJL127W-A	117 nt		0.29	□□□□□ -2.36
MRPS28	P21771	SBH1	YER087C-B	249 nt		0.28	□□□□□ -2.36
MRPS28	P21771	YLR334C	YLR334C	381 nt		0.28	□□□□□ -2.36
MRPS28	P21771	YPR160W-A	YPR160W-A	81 nt		0.28	□□□□□ -2.36
MRPS28	P21771	PAA1	YDR071C	576 nt		0.27	□□□□□ -2.37
MRPS28	P21771	YOR053W	YOR053W	342 nt		0.27	□□□□□ -2.37
MRPS28	P21771	BEM3	YPL115C	3387 nt		0.27	□□□□□ -2.37
MRPS28	P21771	SPO21	YOL091W	1830 nt		0.27	□□□□□ -2.37
MRPS28	P21771	YJL120W	YJL120W	324 nt		0.26	□□□□□ -2.37
MRPS28	P21771	TAR1	YLR154W-C	375 nt		0.26	□□□□□ -2.37
MRPS28	P21771	YOR011W-A	YOR011W-A	207 nt		0.26	□□□□□ -2.37

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