Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb3P09026 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms