Protein–RNA interactions for Protein: E0CX42

Gm4491, Predicted gene 4491, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4491E0CX42 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm4491E0CX42 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm4491E0CX42 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm4491E0CX42 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm4491E0CX42 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm4491E0CX42 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm4491E0CX42 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm4491E0CX42 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm4491E0CX42 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm4491E0CX42 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm4491E0CX42 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm4491E0CX42 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm4491E0CX42 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm4491E0CX42 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm4491E0CX42 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm4491E0CX42 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm4491E0CX42 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm4491E0CX42 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm4491E0CX42 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm4491E0CX42 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm4491E0CX42 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm4491E0CX42 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm4491E0CX42 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm4491E0CX42 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Gm4491E0CX42 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm4491E0CX42 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Gm4491E0CX42 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Gm4491E0CX42 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Gm4491E0CX42 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm4491E0CX42 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm4491E0CX42 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Gm4491E0CX42 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Gm4491E0CX42 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
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Gm4491E0CX42 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm4491E0CX42 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm4491E0CX42 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm4491E0CX42 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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Gm4491E0CX42 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm4491E0CX42 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm4491E0CX42 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm4491E0CX42 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm4491E0CX42 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm4491E0CX42 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm4491E0CX42 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm4491E0CX42 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm4491E0CX42 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm4491E0CX42 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm4491E0CX42 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm4491E0CX42 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm4491E0CX42 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm4491E0CX42 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm4491E0CX42 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm4491E0CX42 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm4491E0CX42 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
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