Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.9 ms