Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms