Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms