Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms