Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms