Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prf1P10820 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prf1P10820 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prf1P10820 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prf1P10820 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prf1P10820 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prf1P10820 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms