Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a3A2ACT7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms