Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc46a3Q9DC26 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc46a3Q9DC26 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.4 ms