Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI2

Slc44a5, Choline transporter-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a5Q5RJI2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc44a5Q5RJI2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms