Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Nkx6-3Q3UHX8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Nkx6-3Q3UHX8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Nkx6-3Q3UHX8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Nkx6-3Q3UHX8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Nkx6-3Q3UHX8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Nkx6-3Q3UHX8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Nkx6-3Q3UHX8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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