Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kdm2aP59997 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm2aP59997 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms