Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prf1P10820 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prf1P10820 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prf1P10820 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prf1P10820 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prf1P10820 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prf1P10820 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prf1P10820 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prf1P10820 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prf1P10820 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prf1P10820 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms