Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms