Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ubl3Q9Z2M6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubl3Q9Z2M6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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