Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
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Card11Q8CIS0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Card11Q8CIS0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
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Card11Q8CIS0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Card11Q8CIS0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Card11Q8CIS0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Card11Q8CIS0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
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Card11Q8CIS0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
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Card11Q8CIS0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Card11Q8CIS0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
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Card11Q8CIS0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Card11Q8CIS0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
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Card11Q8CIS0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
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Card11Q8CIS0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
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Card11Q8CIS0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Card11Q8CIS0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Card11Q8CIS0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Card11Q8CIS0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
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Card11Q8CIS0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Card11Q8CIS0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Card11Q8CIS0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Card11Q8CIS0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
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Card11Q8CIS0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Card11Q8CIS0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
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Card11Q8CIS0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Card11Q8CIS0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
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Card11Q8CIS0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Card11Q8CIS0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Card11Q8CIS0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Card11Q8CIS0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Card11Q8CIS0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Card11Q8CIS0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Card11Q8CIS0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Card11Q8CIS0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Card11Q8CIS0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Card11Q8CIS0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Card11Q8CIS0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Card11Q8CIS0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
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Card11Q8CIS0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Card11Q8CIS0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Card11Q8CIS0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Card11Q8CIS0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Card11Q8CIS0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Card11Q8CIS0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Card11Q8CIS0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Card11Q8CIS0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Card11Q8CIS0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Card11Q8CIS0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Card11Q8CIS0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Card11Q8CIS0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Card11Q8CIS0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
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