Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms