Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI2

Slc44a5, Choline transporter-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a5Q5RJI2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc44a5Q5RJI2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms