Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms