Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brf2Q3UAW9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms