Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TchpQ3TVW5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms