Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sdr16c6Q05A13 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms