Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc8a1P70414 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms