Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Speer4aF8VPX6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4aF8VPX6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms