Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn19Q9ET38 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn19Q9ET38 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn19Q9ET38 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn19Q9ET38 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn19Q9ET38 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn19Q9ET38 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn19Q9ET38 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn19Q9ET38 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn19Q9ET38 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn19Q9ET38 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn19Q9ET38 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn19Q9ET38 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn19Q9ET38 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn19Q9ET38 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn19Q9ET38 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn19Q9ET38 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn19Q9ET38 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn19Q9ET38 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn19Q9ET38 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn19Q9ET38 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn19Q9ET38 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn19Q9ET38 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn19Q9ET38 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Cldn19Q9ET38 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn19Q9ET38 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn19Q9ET38 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn19Q9ET38 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn19Q9ET38 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn19Q9ET38 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn19Q9ET38 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn19Q9ET38 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn19Q9ET38 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn19Q9ET38 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn19Q9ET38 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn19Q9ET38 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Cldn19Q9ET38 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Cldn19Q9ET38 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Cldn19Q9ET38 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Cldn19Q9ET38 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn19Q9ET38 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
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