Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE0

Rnf138, E3 ubiquitin-protein ligase RNF138, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138Q9CQE0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf138Q9CQE0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.7 ms