Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmem260Q8BMD6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem260Q8BMD6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem260Q8BMD6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem260Q8BMD6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem260Q8BMD6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem260Q8BMD6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem260Q8BMD6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem260Q8BMD6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem260Q8BMD6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem260Q8BMD6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem260Q8BMD6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem260Q8BMD6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem260Q8BMD6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem260Q8BMD6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem260Q8BMD6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem260Q8BMD6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem260Q8BMD6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem260Q8BMD6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem260Q8BMD6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem260Q8BMD6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem260Q8BMD6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem260Q8BMD6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem260Q8BMD6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem260Q8BMD6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem260Q8BMD6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem260Q8BMD6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem260Q8BMD6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms