Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Epb41P48193 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epb41P48193 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epb41P48193 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epb41P48193 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epb41P48193 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms