Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms