Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lama1P19137 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lama1P19137 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lama1P19137 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lama1P19137 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lama1P19137 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lama1P19137 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lama1P19137 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lama1P19137 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lama1P19137 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lama1P19137 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lama1P19137 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lama1P19137 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms