Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdc27A2A6Q5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdc27A2A6Q5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdc27A2A6Q5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdc27A2A6Q5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdc27A2A6Q5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdc27A2A6Q5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdc27A2A6Q5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdc27A2A6Q5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdc27A2A6Q5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdc27A2A6Q5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdc27A2A6Q5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdc27A2A6Q5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdc27A2A6Q5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdc27A2A6Q5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdc27A2A6Q5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdc27A2A6Q5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdc27A2A6Q5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdc27A2A6Q5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdc27A2A6Q5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdc27A2A6Q5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdc27A2A6Q5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdc27A2A6Q5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms