Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Irx6Q9ER75 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx6Q9ER75 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms