Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc30Q8BVF4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms