Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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